This study is intended to analyze the ability of the S.aureusstrains isolated from wounds to make biofilm, to assess the presence ofthe genes related to the biofilm formation and the genes related to surfaceproteins, and to compare the phenotypic and genotypic characters of thebiofilm positive and negative strains at the Microbiology and ClinicalMicrobiology Laboratory of Gazi University Faculty of Medicine.A total of 50 S.aureus bacteria isolated from wounds wereincluded to the study. In the study, Congo Red Agar and microplate assaymethod were used to compare the biofilm formation. According to thephenotypic assessment of colony morphology of 50 strains at Congo RedAgar, which was conducted after they were incubated at 37 oC for onenight and then at room temperature for 48 hours, the biofilm production of16 (32%) of the strains was found negative, while that of 34 (68%) strainswas found positive. In microplate method, after the 24-hour incubation at37 oC, absorbance measurements were evaluated after they were paintedby using crystal violet, and then the biofilm production of all the strainswas assessed. According to the absorbance measurements related tousing crystal violet, 17 (34%) strains were negative, 21 (42%) weremoderate and 12 (24%) were strong in terms of biofilm production. Therewas found no statistical relationship between microplate method andCongo Red Agar in terms of biofilm formation, upon their comparison.In the molecular evaluation of the biofilm formation ofS.aureus bacteria, the existence of surface proteins genes (fnbA, clfA veebpS) that has role in the first step of biofilm formation was analyzed aswell as the icaA and icaD genes that has role in the cell-cell adhesion andmulti-layered biofilm formation.In our study, fnbA and clfA genes were detected in 44 (88%)of 50 S.aureus bacteria isolated from wounds while fnbA and clfA geneswere not detected in 6 (12%) strains. Also ebpS genes were detected in23 (46%) strains and were not detected in 17 (34%) strains. There was anormal-to-moderate relation between fnbA and clfA genes and the biofilmformation examined on Congo Red Agar (r=0.274, p<0.001). There was apoor relationship between the biofilm formation and ebpS gene (r=0.031p>0.001). Moreover, there was a poor relation between fnbA gene andbiofilm formation examined with the microplate method (r=0.039, p>0.001).There was a poor relation between the biofilm formation and clfA gene(r=0.028, p>0.001) and a negative relation between the biofilm formationand ebpS gene (r=0.148, p>0.001).In our study, both icaA and icaD genes were determined in42 (84%) strains of 50 S.aureus bacteria isolated from wounds and inS.aureus ATCC 43300 used positively. Neither icaA nor icaD genes weredetermined in 7 (14%) strains of 50 S.aureus bacteria included in thestudy and in S.aureus ATCC 43300 used negatively. In one strain (2%)included in the study, icaA gene was found as positive and icaD gene wasfound as negative. There was a normal-to-moderate relationship betweenicaA and icaD genes and the biofilm formation examined on Congo RedAgar (r=0.285, p=0.001). However, a poor correlation was determinedbetween biofilm formation with the microplate method and icaA and icaDgenes existence (r=0.088, p>0.001).81As a result, no standardization was determined among theconventional methods used in the evaluation of S. aureus biofilmformation. The result of molecular evaluations showed that the genes(fnbA, clfA, icaA ve icaD) was found to be responsible for the biofilmformation of S.aureus have something to do with the biofilm and have anegative relationship with ebpS gene. These results also indicate thatbiofilm formation does not depend only on genotypic features, but itsmechanisms are also affected by the environmental features.Key Words: Staphylococcus aureus, biofilm, surface protein genes, ica genes.

Bu çalışmada ile Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi HastanesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvar'ında yara yerinden izoleS.aureus suşlarının biyofilm yapma yetenekleri, biyofilm oluşumu ile ilişkiligenlerin ve yüzey proteinleri ile ilişkili genlerin varlığının araştırılması,biyofilm pozitif ve negatif suşların fenotipik ve genotipik karakterlerininkarşılaştırılması amaçlanmıştır.Çalışmaya yara yerinden izole edilen 50 S.aureus bakterisidahil edilmiştir. Çalışmada biyofilm oluşumu konvansiyonel yöntem olarakkongo kırmızılı agar besiyeri ve mikrotitrasyon plak yöntemi kullanılarakkarşılaştırılmıştır. Kongo kırmızılı agar besiyerine ekilen 50 S.aureussuşunun 37oC'de bir gece ve sonrasında oda ısısnda 48 saat inkübasyonsonucunda yapılan koloni morfolojisine dayanan fenotipikdeğerlendirmede 16 (%32) örneğin biyofilm oluşumunu negatif bulunurken34 (%68) örneğin biyofilm oluşumu pozitif olarak bulunmuştur.Mikrotitrasyon plağı yönteminde; 37oC'de 24 saatlik inkibasyonun ardındankristal viyole ile boyama sonrasında absorbans ölçümleri yapılarak tümsuşların biyofilm oluşumu değerlendirilmiştir. Kristal viyole kullanılarakyapılan absorbans ölçümlerine göre yara yeri örneklerinin 17'sinde (%34)zayıf biyofilm oluşumu (negatif), 21'inde (%42) orta derece biyofilmoluşumu ve 12'sinde (%24) güçlü biyofilm oluşumu olduğu belirlenmiştir.Kongo kırmızılı agar besiyeri ve mikrotitrasyon plak yöntemi biyofilmoluşumu yönünden karşılaştırıldığında istatiksel olarak uyumlulukbulunmamıştır (p0.05) .77S.aureus bakterisinin biyofilm oluşumunun moleküler olarakdeğerlendirmesinde; biyofilm oluşumunun ilk basamağında görev yapanyüzey proteinleri genlerinin varlığı (fnbA, clfA ve ebpS) ve ikincibasamakta hücre-hücre adezyonu ve çok tabakalı biyofilm oluşumununşekillenmesinde görev alan icaA ve icaD genleri araştırılmıştır.Çalışmamızda yara yerinden izole edilen 50 S.aureusbakterisinin 44'ünde (%88) fnbA ve clfA geni saptanırken 6 (%12) suştafnbA ve clfA geninin varlığı saptanılamamıştır. ebpS geni 23 (%46) suştasaptanırken 17(%34) suşta saptanılamamıştır. Kongo kırmızılı agarbesiyerinde değerlendirilen biyofilm üretimi ile fnbA, clfA genleri arasındanormal-orta derecede ilişki bulunurken (r=0.274, p<0.001). ebpS geniarasında zayıf bir ilişki bulundu (r=0.031, p>0.001). Mikrotitrasyon plağıyönteminde değerlendirilen biyofilm üretimi ile fnbA geni arasında zayıfderecede (r=0.039 p>0.001), clfA geni arasında zayıf derecede (r=0.028p>0.001) ve ebpS geni arasında negatif yönlü zayıf (r=-0.148 p>0.001) birilişki bulunmuştur.Çalışmamızda yara yerinden izole edilen 50 S.aureusbakterisinin 42'sinde (%84) ve pozitif kontrol olarak kullanılan S.aureusATCC 43300 suşunda icaA ve icaD genlerinin her ikiside saptanmıştır.Çalışmaya alınan 50 suşun 7'sinde (%14) ve negatif kontrol olarakkullanılan S.aureus ATCC 29213 icaA ve icaD genleri saptanamadı.Çalışmaya katılan 1 (%2) suşda icaA pozitif, icaD geni ise negatif olaraksaptanmıştır. Kongo kırmızlı agar besiyerinde değerlendirilen biyofilmoluşumu ile icaA ve icaD genleri arasında normal-orta derecede ilişkilibulunmuştur (r=0.285, p=0.001). Mikrotitrasyon plağı yöntemindedeğerlendirilen biyofilm oluşumu ile icaA ve icaD genleri arasında zayıf birkorelasyon saptanmıştır (r=0.088 p>0.001).Sonuç olarak; S.aureus biyofilm oluşumundadeğerlendirilmesinde kullanılan konvansiyonel yöntemler arasındastandardizasyon saptanılamamıştır. Yapılan moleküler değerlendirmesonucunda S.aureus'un biyofilm oluşumu ile sorumlu tutulan (fnbA, clfA,icaA ve icaD) genlerin biyofilm ile ilişkisi olduğu ve ebpS ile negatif yönlübir ilişkinin bulunduğu ancak biyofilm oluşumunun tek başına genotipiközelliklere bağlı olmadığı, çevresel ve suşa ait özelliklerin de biyofilmoluşum mekanizmalarını etkilediği düşünülmektedir.Anahtar kelimeler; Staphylococcus aureus, biyofilm, yüzey protein genleri, ica genleri.