Several new direct-acting antiviral drugs are in development for chronic hepatitis C viral infection and NS3-NS4A serine protease have been one of the major target. HCV variants displaying drug-resistant phenotypes have been observed both in vitro and clinical trials. As a consequence of selective pressure exerted by the host immun leukocyte antigen (HLA)- restricted immun responses during HCV infection, a high rate of nucleotide mutations in the viral genome is observed which leads to the emergence of viral escape mutations. The aim of this study was to chracterize amino acid changes at the positions associated with resistance to protease inhibitors and the changes in the CTL epitopes, in protease inhibitor naive liver allograft recipients infected with HCV genotype 1b.Resistance associated variants were found in 3 patients (3/5). Three different resistance associated variants (155G,168A and 168G) were observed in 14 serum samples. Our results demonstrated existing of naturally occuring resistance variants in HCV infected liver allograft recipients .CD8+ cell epitopes for NS3 region that are specified as HCV genotype 1 were downloaded from public databases.Epitopes from HLA transgenic mammalian cells were excluded. Samples were analysed and epitopes conservancy rates of 14 samples were between 28%-57.3%.Identification of naturally occuring drug-resistance variants in HCV infected liver allograft recipients before triple therapy could asist to predict responses therapy outcomes. Characterization of immun escape and drug resistance profiles may provide important information defining an individual's drug regimen.

NS3-NS4A serin proteaz,kronik hepatit C virüs enfeksiyonu için geliştirilmekte olan direk etkili antiviral (DEA) ilaçların temel hedeflerinden biridir. HCV enfeksiyonu sırasında lökosit hücre antijenleri tarafından oluşturulan seçici baskının sonucu olarak, viral genomda yüksek seviyede nükleotit mutasyonu gözlenmekteve viral kaçış mutasyonlarının meydana çıkmasına neden olmaktadır. Bu çalışmanın amacı, proteaz inhibitöreleri yönünden naif, HCV genotip 1b ile enfekte karaciğer alıcılarında, daha önce proteaz bölgesinde ilaç direnciyle ilişkilendirilmiş amino asit değişimlerini ve CTL epitoplarındaki değişimleri karakterize etmektir.Dirençle ilişkilendirilen varyantlar 3 hastada bulunmuştur (3/5). Toplam 14 serum örneğinde 3 farklı (155G,168A ve 168G) dirençli varyant bulunmuştur. Sonuçlarımız, HCV ile enfekte ve proteaz inhibitörü kullanmayan karaciğer organ alıcılarında kendiliğinden oluşan dirençli varyantların varlığını göstermiştir.İki farklı veri bankasından NS3 bölgesinde bulunan ve HCV genotip 1 olarak bildirilen CTL epitopları indirilmiştir. Transgenik memeli hücrelerinden gelen epitoplar ve HLA tipi belirsiz olanlar dışlanmıştır. Beş hastadan elde edilen 14 serum örneğinin CTL epitoplarının korunmuşluk oranları %28 ile %57.3 arasındadır. HCV ile enfekte karaciğer organ alıcılarında kendiliğinden oluşan dirençli varyantların proteaz inhibitörleriyle üçlü sağaltıma başlanmadan önce tanımlanması, sağaltıma yanıtı tahmin etmede yardımcı olabilir. Bağışık yanıttan kaçış ve ilaç direnci profillerinin karakterizasyonu, kişinin ilaç rejiminin belirlenmesinde önemli bilgiler sağlayabilir.