This study aimed to identify whether the signature of phosphorylation ordephoshorylation of the proteins involved in glucose sensing, signal transduction andglucose repression pathways can be observed at the transcription of the genes encodingthose proteins. S. cerevisiae BY4743 strains (ho/ho, hap4/hap4, rip1/rip1 andRIP1/rip1) were cultivated under nitrogen limited condition in order to identify thevariations in the expression levels of genes involved in glucose sensing, signal transductionand glucose repression pathways as a response to system level perturbations. Metaboliteprofiles for glucose, ethanol, ammonia and glycerol were obtained as well as the growthcurves. Expression profiles of CYC8, GRR1, MTH1, RGT1, RGT2, SKP1, SNF3,STD1,TUP1, YCK1, YCK2, ELM1, GLC7,HXK2, MIG1, PAK1, REG1, SNF1, SNF4,TOS3, HAP4, MBA1 genes were determined. The cell densities of the ho/ho,rip1/rip1 and RIP1/rip1 mutants decreased whereas growth of hap4/hap4 mutantincreased in response to nitrogen pulse. Highest cell density was obtained in ho/ho andhap4/hap4 strains at the second steady state. The ethanol production was higher inrespiratory deficient hap4/hap4 and rip1/rip1 mutants. Glycerol production wassignificantly lower in RIP1 mutations in comparison to the other studied strains. Theexpression level of MIG1, MBA1, GRR1 and REG1 increased in response to nitrogen pulsein all studied mutants. RIP1 deletion resulted in the repression of HAP4, MTH1, SKP1RGT1, MBA1 and YCK1 genes. Respiratory deficiency seems to affect the expression ofRGT1, MBA1 and may be the reason for the dissimilarity observed between the expressionprofiles of MIG1-HXK2, GRR1-SKP1 and MIG1-CYC8-TUP1. The deletion of HAP4 doesnot seem to affect significantly the expression patterns of REG1, GLC7, MIG1, SNF1 andSNF4. HAP4 seems to plays an important role in nitrogen catabolite repression in yeast.Deletion of RIP1 seems to affect the transcriptional response of HAP4 in nitrogencatabolite repression in yeast.

Azot kaynagını eksik miktarlarda içeren F1 kullanılarak kontrollü (sıcaklık, pH,çözünmüs oksijen, karıstırma hızı) kesiksiz fermentasyon kosullarında (kemostat) S.cerevisiae BY4743'nin gen delesyonu tasıyan ho/ho, hap4/hap4, rip1/rip1 veRIP1/rip1 susları büyütüldü. Ortama amonyum sülfatın darbe (pulse) seklinde eklenerekbesin sınırlandırılmasının kaldırılması sonucu glukoz algılama, sinyal iletimi ve glukozbaskılama yolizinde görev alan genlerin gen anlatımındaki degisimler gözlenmistir.Susların büyütülmesi sırasında belirli zaman aralıklarında alınan örneklerde biyokütle,etanol, glukoz, gliserol ve amonyak derisimleri belirlenmistir. Gen anlatımı profilleriincelenen genler CYC8, GRR1, MTH1, RGT1, RGT2, SKP1, SNF3, STD1,TUP1, YCK1,YCK2, ELM1, GLC7,HXK2, MIG1, PAK1, REG1, SNF1, SNF4, TOS3, HAP4 ve MBA1'dır. Amonyum sülfat darbe (pulse) seklinde eklendikten sonra ho/ho, rip1/rip1 veRIP1/rip1 suslarının hücre üretimlerinde azalma gözlenirken, hap4/hap4 susunda artısgözlenmistir. ho/ho ve hap4/hap4 susları daha yüksek miktarda hücre üretmistir. Enyüksek etanol derisimi, solunum eksikligi gözlenen hap4/hap4 ve rip1/rip1suslarında belirlenmistir. RIP1 geni silinen suslarda gliserol derisiminde azalmasaptanmıstır. MIG1, MBA1, GRR1 ve REG1 genlerinin anlatımı çalısılan bütün suslardaazot eklenmesinden sonra artıs göstermistir. RIP1 geni silinen suslarda, HAP4, MTH1,SKP, RGT1, MBA1 ve YCK1 genlerinin anlatımının baskılandıgı gözlenmistir. RGT1,MBA1 genlerinin anlatımının ve MIG1-HXK2, GRR1-SKP1 ve MIG1-CYC8-TUP1genlerinin anlatımları arasındaki benzerligin solunum eksikliginden etkilendigisaptanmıstır. hap4/hap4 susunun REG1, GLC7, MIG1 SNF1 ve SNF4 genlerininanlatımında etkili olmadıgı saptanmıstır. HAP4 geninin azot metabolizmasında etkili birrol oynadıgı düsünülmektedir. RIP1 geni silinmis suslarda, HAP4 geninin azotmetabolizmasındaki etkisinde farklılık belirlenmistir.