Tez detayları

Biyotinleyici ayırma sistemlerinin geliştirilmesi ve uygulamaları = Development and application of biotinylating separation systems

Yazarlar:

Köse, Semra Özgün

Yayıncı:

Anadolu Üniversitesi

Ana Başlıklar:

Biyokimya | Kimya ve ilgili bilimler

Belge Tipi:

Tezler

Program Tipi:

Yüksek Lisans

Yayın Tarihi:

12/2014

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000376006

Anahtar sözcükler:

Özet

In this study, biotinylation of primers from 5' end using cryogel column synthesized by ruthenium-based photosensitive cross-linking technique has been realized. For this purpose, firstly, DNA ligase cross-linked HEMA and monolithic photosensitive monomer based cryogel colum have been developed and characterized.In the second part of the study, avidity efficiency has been formed via binding of biotin to 5' end of the primer having Crimean Congo Hemorrhagic Fever (CCHF) by using synthesized enzyme based cryogel column system. The proof of this interaction has been performed by observation of increase the absorption of the samples at 354 nm using microplate reader. The efficiency of the designed primers having CCHF has been proved by using polymerase chain reaction (PCR).In the last step of this study, streptavidin cross-linked and photostable Quantum nanocrystals (QDs) having fluorescence property have been formed and biotinylated 5'-ssDNA probes have bound to streptavidin-QD platforms. Then, the fluorescence changes based on the hybridization of 3'-ssDNA complements which cause diagnosis of disease have been investigated.

Bu çalışmada; rutenyum tabanlı amino asit monomerleriyle fotosensitif çapraz bağlama (ANADOLUCA) metoduna göre sentezlenen kriyojel kolon aracılığıyla primerlerin 5' ucundan biyotinlenmesi tek basamakta gerçekleştirilmiştir. Bu amaçla; ilk olarak DNA ligaz çapraz bağlı HEMA ve fotosensitif monomer tabanlı monolitik kriyojel kolon geliştirilmiş ve karakterize edilmiştir.Çalışmanın ikinci aşamasında, sentezlenen enzim tabanlı kriyojel kolon sistemi ile Kırım-Kongo Kanamalı Ateşi (KKKA) hastalığına sahip olan primerin 5' ucuna biyotin bağlanarak avidite etkinliği oluşturulmuştur. Bu etkileşimin ispatı, numunelerin mikroplaka okuyucu ile 354 nm' de elde edilen absorbans değerlerinde görülen artış ile yapılmıştır. Tasarlanan KKKA hastalığına sahip olan primerlerin etkinliği ise polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile kanıtlanmıştır.Çalışmanın son aşamasında, floresans özelliği gösteren streptavidin çapraz bağlı ve fotostabil Kuvantum nanokristaller (QD) oluşturulmuş ve biyotinlenmiş 5'-ssDNA problar streptavidin-QD platformlara bağlanmıştır. Daha sonra; hastalık tanısı gerçekleştirecek 3'-ssDNA komplementerinin hibridizasyonuna dayalı floresans değişimleri incelenmiştir.

Tez detayları

Biyotinleyici ayırma sistemlerinin geliştirilmesi ve uygulamaları = Development and application of biotinylating separation systems

Yazarlar: Köse, Semra Özgün

Yayıncı: Anadolu Üniversitesi

Ana Başlıklar: Biyokimya | Kimya ve ilgili bilimler

Belge Tipi: Tezler

Program Tipi: Yüksek Lisans

Yayın Tarihi: 12/2014

Belge Dili: Türkçe

Document ID (Org No.): 2000376006