Tez detayları

Kütahya yöresinde kenelerde kırım kongo kanamalı ateşi virüsünün moleküler yöntemlerle araştırılması = Investigation of CCHF virus in ticks with molecular methods in kutahya province

Yazarlar:

Çetin, Hülya

Yayıncı:

Dumlupınar Üniversitesi

Ana Başlıklar:

Biology

Belge Tipi:

Tezler

Program Tipi:

Yüksek Lisans

Yayın Tarihi:

12/2013

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000136245

Anahtar sözcükler:

Biyoloji

Özet

Ticks are obligatory blood-sucking ectoparasites and known as the vectors of many deadly diseases. CCHF virus is one of the most important vectors of this disease and belong to the family of Bunyaviridae is located under the Nairovirus genus. In our study, as a result of field studies, the total of 228 mature ticks were collected from farm animals in the region of Kütahya and the identifications of these species were made in the laboratory. A total of six species were identified as Hyalomma marginatum, Dermacentor marginatus, Rhipicephalus sanguineus, Rhipicephalus bursa, Rhipicephalus turanicus, Rhipicephalus (Boophilus) annulatus. 88 pools were formed accordance with these species and genders. Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and nested PCR molecular methods were used in order to identifiy these viruses and to determine the sequence of the S segment of the virus from this pool. The presence of CCHF virus detected in 10 pools, and only determined in H. marginatum species. As a result of the phylogenetic analysis of the positive isolates, it is determined that CCHF viruses isolated in this study have the same clusters with the strains predetermined in Southwestern Russia, Kosovo and Turkey.Keywords: Ticks, CCHF virus, Nested-RT-PCR, S segment, Kutahya.

Keneler zorunlu kan emici ektoparazitlerden olup birçok ölümcül hastalık etkenlerinin de vektörü olarak bilinmektedir. Bu hastalık etkenlerinden en önemlilerinden biri olan KKKA virüsü Bunyaviridae ailesinden Nairovirüs cinsinde yer almaktadır. Çalışmamızda, Kütahya yöresinde saha çalışmaları neticesinde çiftlik hayvanlarından toplam 228 olgun kene toplanmış ve bunların laboratuvar ortamında tür teşhisleri yapılmıştır. Hyalomma marginatum, Dermacentor marginatus, Rhipicephalus sanguineus, Rhipicephalus bursa, Rhipicephalus turanicus, Rhipicephalus (Boophilus) annulatus olmak üzere toplam altı tür saptanmıştır. Bu türlere ve cinsiyetlerine göre 88 havuz oluşturulmuştur. Bu havuzlardan virüs tespiti ve virüsün S segmentinin sekansını belirleyebilmek için Reverse Transkripsiyon Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RT-PCR) ve Nested PCR moleküler yöntemleri kullanılmıştır. 10 havuzda KKKA virüsünün varlığı saptanmış ve sadece H. marginatum türünde tespit edilmiştir. Pozitif bulunan izolatların filogenetik analizleri sonucunda, bu çalışmada izole edilen KKKA virüs izolatının Güneybatı Rusya, Kosova ve Türkiye'de önceden belirlenmiş suşlar ile aynı clusterda yer aldığı saptanmıştır.Anahtar Kelimeler: Keneler, KKKA virüsü, Nested-RT-PCR, S segmenti, Kütahya.

Tez detayları

Kütahya yöresinde kenelerde kırım kongo kanamalı ateşi virüsünün moleküler yöntemlerle araştırılması = Investigation of CCHF virus in ticks with molecular methods in kutahya province

Yazarlar: Çetin, Hülya

Yayıncı: Dumlupınar Üniversitesi

Ana Başlıklar: Biology

Belge Tipi: Tezler

Program Tipi: Yüksek Lisans

Yayın Tarihi: 12/2013

Belge Dili: Türkçe

Document ID (Org No.): 2000136245