Genetic analysis of 71 Rett Syndrome patients revealed that MECP2 mutations were present in 68.2% of a clinically well defined group and only in 12.5% of patients with a heterogeneous phenotype. For the first time, we identified gene duplications as causative mutations in atypical RTT females. Genotype/phenotype correlation for the patients with mutations did not reveal a statistically significant correlation. Additionally, we developed a novel multiplexed ARMS assay for identification of seven common mutations accounting for almost 65 per cent of all MECP2 gene mutations. Furthermore, we showed that Real Time PCR analysis was reliable for determination of the exon copy number if the DNA amount is in range of 1-50 ng.Hypermethylation of hHR23A gene and the presence of methylated conserved motifs and transcription binding sites in hHR23B gene were observed in breast tumor tissues. To our knowledge, this is the first study suggesting the involvement of hHR23 gene methylation in breast carcinogenesis.Identification of a TTF2 mutation in a patient with Congenital Hypothyroidism and its functional study provided evidence for differential effects of TTF2 mutations on downstream target genes required for thyroid organogenesis. Additionally, our patient was the first case with CH that suffered plasma cholinesterase deficiency.

Rett Sendromu' nun (RTT) genetik temeli toplam 71 hastada incelendi. Kesin klinik tanı alan hastaların yüzde 68.2'sinde heterojen dağılım gösteren ve hastalığa neden olduğu bilinen MECP2 gen mutasyonları tanımlanırken, ayırımcı tanı amacıyla yönlendirilen hastaların sadece yüzde 12.5'inde mutasyon belirlendi. Atipik RTT olgularında, ilk defa, gen duplikasyon mutasyonlarının hastalığa neden olabileceği gösterildi. Hastalık şiddeti skorları ile mutasyonların tipi ve konumlarının, ve XCI paterninin karşılaştırılması temeline dayanan genotip/fenotip korelasyonu gerçekleştirildi. Bulgular istatiksel olarak anlamlı bir korelasyonu göstermedi. Ayrıca bilinen tüm MECP2 gen mutasyonlarının yüzde 65'ini oluşturan ve en sık görülen yedi mutasyonun tanımlanması amacıyla yeni bir multipleks amplifikasyon refrakter mutasyon tanımlama sistemi (ARMS) geliştirildi ve geçerliliği sınandı. Bunun yanı sıra, DNA konsantrasyonunun, MECP2 ekson düzenleme bozukluklarının belirlenmesinde kullanılan SYBER yeşili boya-bazlı Gerçek Zamanlı PCR analizinin güvenilirliği ve tekrarlanabilirliği üzerindeki etkisi irdelendi. Ekson kopya sayısının belirlenmesi çalışmalarında, DNA miktarının 1-50 ng aralığında olduğu durumlarda Gerçek Zamanlı PCR analizinin güvenilir sonuçlar verdiği gösterildi.Analiz edilen tümör dokularında hHR23A gen hipermetilasyonu, hHR23B geninde korunmuş metilasyon motifleri ve transkripsiyon bağlanma bölgelerinde metilasyon belirlenmiştir. Bilgimiz dahilinde, hHR23 genlerinin metilasyonunun meme kanseri oluşumunda yer alabileceğini gösteren ilk çalışmadır.Konjenital hipotiroidizm hastasında TTF2 mutasyonu berirlenmesi ve işlevsel analizler TTF2 mutasyonlarının normal insan tiroid organogenezinde rol alan hedef genler üzerindeki farklı etkilerine işaret eden özgün kanıt sağladı. Ayrıca incelenen hasta plazma kolin esteraz yetersizliği gösteren ilk konjenital hipotiroidizm olgusudur.