YABANCI OTLARIN MOLEKÜLER TEŞHİSİNDE RİBOZOMAL RNA (rRNA) İNTERNAL TRANSCRIBED SPACER (ITS) GEN BÖLGELERİNİN KULLANIMI

Seçil EKER; Onur KOLÖREN

Makale detayları

YABANCI OTLARIN MOLEKÜLER TEŞHİSİNDE RİBOZOMAL RNA (rRNA) İNTERNAL TRANSCRIBED SPACER (ITS) GEN BÖLGELERİNİN KULLANIMI

Yazarlar:

Seçil EKER | Onur KOLÖREN

Yayıncı:

Ordu University

Dergi:

Ordu University Journal of Science and Tecnology 2017 Vol.7 Issue 1, pp.11-21

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

6/2017

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000548779

Sıklık:

İki Yıllık

eISSN:

2146-6459

pISSN:

2146-6440

Özet:

 


Bu
derlemede yabancı otların sistematiğinde Ribozomal RNA (rRNA) Internal Transcribed Spacer (ITS) gen bölgelerinin kullanımı
hakkında bilgi değerlendirilmektedir. Son yıllarda gerçekleştirilen
moleküler çalışmalar yabancı otların teşhisinde önemli düzeyde destek
sağlamaktadır. Kullanılan moleküler yöntemler yardımıyla morfolojik olarak çok
benzerlik gösteren tür ve tür içi varyasyonların tespit edilmesi mümkün
olmaktadır. Bitkilerin moleküler sistematiğinde, tür ve tür içi popülasyonların
filogenetik analizlerinde en fazla tercih edilen moleküler markörlerden birisi
rRNA-ITS gen bölgeleridir. Genomik DNA üzerinde rRNA’lar ardışık sıralı
tekrarlar şeklinde olup tür içi seviyelerinde ileri derecede korunmuş gen
bölgelerini oluşturmaktadır. Bu rRna gen bölgelerine komşu olarak bulunan, özellikle
18S ve 5.8S arasındaki ITS1 ile 5.8S ve 28S arasındaki ITS2 gen dizileri rRNA
gen bölgelerine oranla daha fazla nükleotid baz değişimi göstermektedir. ITS
bölgelerinin yüksek oranda varyasyon göstermeleri taksonlar arasındaki
filogenetik ilişkilerin belirlenmesinde, cinsler arasında ve tür seviyesinde
taksonomik sorunların çözülmesinde tercih edilmesine nedendir. Ayrıca, bu
moleküler markörler genoma bağlı olduklarından güvenlidirler, tekrarlanabilir
ve laboratuvarlar arasında standardize edilebilirler, genomda birden fazla
bölgeyi belirleme imkanına sahiptirler ve çevre koşullarından etkilenmezler. 

.

Makale detayları

YABANCI OTLARIN MOLEKÜLER TEŞHİSİNDE RİBOZOMAL RNA (rRNA) İNTERNAL TRANSCRIBED SPACER (ITS) GEN BÖLGELERİNİN KULLANIMI

Yazarlar: Seçil EKER | Onur KOLÖREN

Yayıncı: Ordu University

Dergi: Ordu University Journal of Science and Tecnology 2017 Vol.7 Issue 1, pp.11-21

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 6/2017

Belge Dili: Türkçe

Document ID (Org No.): 2000548779

Sıklık: İki Yıllık

eISSN: 2146-6459

pISSN: 2146-6440

Sayı

Yazarlar:

Seçil EKER | Onur KOLÖREN

Yayıncı:

Ordu University

Dergi:

Ordu University Journal of Science and Tecnology 2017 Vol.7 Issue 1, pp.11-21

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

6/2017

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000548779

Sıklık:

İki Yıllık

eISSN:

2146-6459

pISSN:

2146-6440