Characterization of the complete mitogenomic and phylogenetic of the Columba livia breed Şebap pigeon

Romedi Çelik; Nüket Bilgen; Akın Yiğin; Şükrü Gürler; Faruk Bozkaya; Furkan Kutlu; Mustafa Yenal Akkurt

Makale detayları

Characterization of the complete mitogenomic and phylogenetic of the Columba livia breed Şebap pigeon

Yazarlar:

Romedi Çelik | Nüket Bilgen | Akın Yiğin | Şükrü Gürler | Faruk Bozkaya | Furkan Kutlu | Mustafa Yenal Akkurt

Yayıncı:

Ankara University

Ana Başlıklar:

Animal Science | Genetics and Biostatistics

Dergi:

Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi Vol.72 Issue 2, pp.145-153

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

1/2025

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2001343145

pISSN:

1300-0861

Anahtar kelimeler:

Özet:

 Gen kaynaklarının korunmasına odaklanan çalışmaların ilk aşaması, mevcut ırkların fenotipik ve genetik karakterizasyonunu içermektedir. Genetik analizler için oldukça uygun olan mitokondriyal DNA mtDNA seviyesindeki farklılıkların açıklanması, yerel ırklar arasında genetik mesafelerin hesaplanabilmesini, evrimsel analizler aracılığıyla potansiyel evcilleştirme merkezlerinin belirlenebilmesini ve ırklar arasındaki akrabalık ilişkilerini gösteren filogeni ağaçlarının oluşturulabilmesini mümkün kılar. Şanlıurfa, geleneksel güvercin yetiştiriciliğinin uzun bir geçmişe sahip olması ve güvercin evcilleştirmesi merkezlerinden biri olması nedeniyle güvercin yetiştiriciliğinde önem taşımaktadır. Bu çalışma, Şanlıurfa iline özgü güvercin ırklarından Şebap güvercinini tüm mtDNA dizisi açısından karakterize etmeyi amaçlamaktadır. Şebap güvercininin mitokondriyal genomu, 17,232 bp boyutunda olup, 13 Protein-Kodlayan Gen PCG, iki Ribozomal RNA rRNA ve 22 Transfer RNA tRNA içermektedir. Genel mitokondriyal genom kompozisyonu, sırasıyla 29.6 A, 24.5 T, 31.2 C ve 14.7 G içermekte olup, belirgin bir şekilde 54.1 A-T zenginliğine sahiptir. Özellikle, ND6 L zincirinde kodlanırken diğerleri H zincirinde kodlanmaktadır.

 Gen kaynaklarının korunmasına odaklanan çalışmaların ilk aşaması, mevcut ırkların fenotipik ve genetik karakterizasyonunu içermektedir. Genetik analizler için oldukça uygun olan mitokondriyal DNA mtDNA seviyesindeki farklılıkların açıklanması, yerel ırklar arasında genetik mesafelerin hesaplanabilmesini, evrimsel analizler aracılığıyla potansiyel evcilleştirme merkezlerinin belirlenebilmesini ve ırklar arasındaki akrabalık ilişkilerini gösteren filogeni ağaçlarının oluşturulabilmesini mümkün kılar. Şanlıurfa, geleneksel güvercin yetiştiriciliğinin uzun bir geçmişe sahip olması ve güvercin evcilleştirmesi merkezlerinden biri olması nedeniyle güvercin yetiştiriciliğinde önem taşımaktadır. Bu çalışma, Şanlıurfa iline özgü güvercin ırklarından Şebap güvercinini tüm mtDNA dizisi açısından karakterize etmeyi amaçlamaktadır. Şebap güvercininin mitokondriyal genomu, 17,232 bp boyutunda olup, 13 Protein-Kodlayan Gen PCG, iki Ribozomal RNA rRNA ve 22 Transfer RNA tRNA içermektedir. Genel mitokondriyal genom kompozisyonu, sırasıyla 29.6 A, 24.5 T, 31.2 C ve 14.7 G içermekte olup, belirgin bir şekilde 54.1 A-T zenginliğine sahiptir. Özellikle, ND6 L zincirinde kodlanırken diğerleri H zincirinde kodlanmaktadır.

 Gen kaynaklarının korunmasına odaklanan çalışmaların ilk aşaması, mevcut ırkların fenotipik ve genetik karakterizasyonunu içermektedir. Genetik analizler için oldukça uygun olan mitokondriyal DNA mtDNA seviyesindeki farklılıkların açıklanması, yerel ırklar arasında genetik mesafelerin hesaplanabilmesini, evrimsel analizler aracılığıyla potansiyel evcilleştirme merkezlerinin belirlenebilmesini ve ırklar arasındaki akrabalık ilişkilerini gösteren filogeni ağaçlarının oluşturulabilmesini mümkün kılar. Şanlıurfa, geleneksel güvercin yetiştiriciliğinin uzun bir geçmişe sahip olması ve güvercin evcilleştirmesi merkezlerinden biri olması nedeniyle güvercin yetiştiriciliğinde önem taşımaktadır. Bu çalışma, Şanlıurfa iline özgü güvercin ırklarından Şebap güvercinini tüm mtDNA dizisi açısından karakterize etmeyi amaçlamaktadır. Şebap güvercininin mitokondriyal genomu, 17,232 bp boyutunda olup, 13 Protein-Kodlayan Gen PCG, iki Ribozomal RNA rRNA ve 22 Transfer RNA tRNA içermektedir. Genel mitokondriyal genom kompozisyonu, sırasıyla 29.6 A, 24.5 T, 31.2 C ve 14.7 G içermekte olup, belirgin bir şekilde 54.1 A-T zenginliğine sahiptir. Özellikle, ND6 L zincirinde kodlanırken diğerleri H zincirinde kodlanmaktadır.

 Gen kaynaklarının korunmasına odaklanan çalışmaların ilk aşaması, mevcut ırkların fenotipik ve genetik karakterizasyonunu içermektedir. Genetik analizler için oldukça uygun olan mitokondriyal DNA mtDNA seviyesindeki farklılıkların açıklanması, yerel ırklar arasında genetik mesafelerin hesaplanabilmesini, evrimsel analizler aracılığıyla potansiyel evcilleştirme merkezlerinin belirlenebilmesini ve ırklar arasındaki akrabalık ilişkilerini gösteren filogeni ağaçlarının oluşturulabilmesini mümkün kılar. Şanlıurfa, geleneksel güvercin yetiştiriciliğinin uzun bir geçmişe sahip olması ve güvercin evcilleştirmesi merkezlerinden biri olması nedeniyle güvercin yetiştiriciliğinde önem taşımaktadır. Bu çalışma, Şanlıurfa iline özgü güvercin ırklarından Şebap güvercinini tüm mtDNA dizisi açısından karakterize etmeyi amaçlamaktadır. Şebap güvercininin mitokondriyal genomu, 17,232 bp boyutunda olup, 13 Protein-Kodlayan Gen PCG, iki Ribozomal RNA rRNA ve 22 Transfer RNA tRNA içermektedir. Genel mitokondriyal genom kompozisyonu, sırasıyla 29.6 A, 24.5 T, 31.2 C ve 14.7 G içermekte olup, belirgin bir şekilde 54.1 A-T zenginliğine sahiptir. Özellikle, ND6 L zincirinde kodlanırken diğerleri H zincirinde kodlanmaktadır.

Makale detayları

Characterization of the complete mitogenomic and phylogenetic of the Columba livia breed Şebap pigeon

Yazarlar:

Romedi Çelik | Nüket Bilgen | Akın Yiğin | Şükrü Gürler | Faruk Bozkaya | Furkan Kutlu | Mustafa Yenal Akkurt

Yayıncı:

Ankara University

Ana Başlıklar:

Animal Science | Genetics and Biostatistics

Dergi:

Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi Vol.72 Issue 2, pp.145-153

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

1/2025

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2001343145

pISSN:

1300-0861

Şanlıurfa

pigeon breeding

mitochondrial DNA

genetic characterization

evolutionary analysis

phylogeny tree

Sayı

Makale detayları

Characterization of the complete mitogenomic and phylogenetic of the Columba livia breed Şebap pigeon

Yazarlar: Romedi Çelik | Nüket Bilgen | Akın Yiğin | Şükrü Gürler | Faruk Bozkaya | Furkan Kutlu | Mustafa Yenal Akkurt

Yayıncı: Ankara University

Ana Başlıklar: Animal Science | Genetics and Biostatistics

Dergi: Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi Vol.72 Issue 2, pp.145-153

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 1/2025

Belge Dili: İngilizce

Document ID (Org No.): 2001343145

pISSN: 1300-0861

Şanlıurfa

pigeon breeding

mitochondrial DNA

genetic characterization

evolutionary analysis

phylogeny tree

Sayı

Yazarlar:

Romedi Çelik | Nüket Bilgen | Akın Yiğin | Şükrü Gürler | Faruk Bozkaya | Furkan Kutlu | Mustafa Yenal Akkurt

Yayıncı:

Ankara University

Ana Başlıklar:

Animal Science | Genetics and Biostatistics

Dergi:

Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi Vol.72 Issue 2, pp.145-153

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

1/2025

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2001343145

pISSN:

1300-0861