Characterization of Autochthonous Grapevine Cultivars (Vitis vinifera L.) from the Aegean Region of Turkey Using Simple Sequence Repeats (SSRs)

Burçak İŞÇİ; Yıldız DİLLİ

doi:https://doi.org/10.1501/Tarimbil_0000001355

Makale detayları

Characterization of Autochthonous Grapevine Cultivars (Vitis vinifera L.) from the Aegean Region of Turkey Using Simple Sequence Repeats (SSRs)

Yazarlar:

Burçak İŞÇİ | Yıldız DİLLİ

Yayıncı:

Ankara University

Dergi:

Journal of Agricultural Sciences 2015 Vol.21 Issue 4, pp.538-545

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

12/2015

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000608148

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

2148-9297

DOI:

https://doi.org/10.1501/Tarimbil_0000001355

Özet:

 


Thirty-six autochthonous grapevine cultivars from the Aegean region of Turkey in addition to standard cultivars Cabernet
Sauvignon and Merlot (Vitis vinifera L.) were fingerprinted using SSR markers to assess their genetic relationships.
Eleven SSR primers produced successful amplifications and yielded 37 polymorphic bands. The number of bands per
primer changed between 2 and 6 while the number of polymorphic bands was between 2 and 3.6. Dice genetic similarity
coefficients ranged between 0.296 and 0.882 among the genotypes. The UPGMA dendrogram showed two main groups.
The first group was composed of Sultan Dimriti, Veyis and Güvercin Gözü cultivars. A large number of sub-groups were
placed in the second group which included the majority of autochthonous cultivars. The genetic differences among the
autochthonous cultivars and reference cultivars were clearly observed. The results showed that cultivars Siyah Razakı
and Parmak (0.96) were the most similar ones. Synonyms were identified for İnek Memesi and Ufak Dimrit cultivars.
In addition, homonymous cultivars were detected. SSR markers have proved to be an efficient tool for fingerprinting
grapevine cultivars and conducting genetic diversity studies.

.

 

Türkiye᾽nin Ege bölgesinde yetiştirilen otuz altı yerel asma çeşidi ile standart çeşitlerden Cabernet Sauvignon ve Merlot
 arasındaki genetik ilişkiler SSR markörleri kullanılarak belirlenmiştir. Kullanılan 11 SSR primeri başarılı amplifikasyonlar
 vermiş ve toplam 37 polimorfik bant üretmiştir. Bant sayısı primer başına 2 ile 6 arasında ve polimorfik bant sayısı 2 
 ile 3.6 arasında değişmiştir. Genotipler arasındaki Dice genetik benzerlik katsayıları 0.296 ile 0.882 arasında değişim
 göstermiştir. UPGMA dendrogramında iki ana grup ortaya çıkmıştır. Birinci grup Sultan Dimriti, Veyis ve Güvercin
 Gözü çeşitlerinden oluşmuştur. Yerel çeşitlerin büyük kısmının yer aldığı ikinci grup çok sayıda alt gruptan oluşmuştur.
 Yerel asma çeşitleri ve referans çeşitler arasındaki genetik farklılıklar açıkça gözlenmiştir. En yüksek (0.96) genetik
 benzerliğin Siyah Razakı ve Parmak çeşitleri arasında olduğu belirlenmiştir. İnek Memesi ve Ufak Dimrit çeşitlerinin
 birbirinin sinonimi olduğu tespit edilmiştir. Ayrıca homonim çeşitlerin varlığı da ortaya çıkarılmıştır. Sonuçlar, SSR
 markörlerinin asma çeşitlerinin parmak izi ve genetik çeşitlilik çalışmalarında etkin bir araç olduğunu göstermektedir.

Makale detayları

Characterization of Autochthonous Grapevine Cultivars (Vitis vinifera L.) from the Aegean Region of Turkey Using Simple Sequence Repeats (SSRs)

Yazarlar: Burçak İŞÇİ | Yıldız DİLLİ

Yayıncı: Ankara University

Dergi: Journal of Agricultural Sciences 2015 Vol.21 Issue 4, pp.538-545

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 12/2015

Belge Dili: İngilizce

Document ID (Org No.): 2000608148

Sıklık: Üç Aylık

eISSN: 2148-9297

DOI: https://doi.org/10.1501/Tarimbil_0000001355

Sayı

Yazarlar:

Burçak İŞÇİ | Yıldız DİLLİ

Yayıncı:

Ankara University

Dergi:

Journal of Agricultural Sciences 2015 Vol.21 Issue 4, pp.538-545

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

12/2015

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000608148

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

2148-9297

DOI:

https://doi.org/10.1501/Tarimbil_0000001355