Genomik DNA izolasyon metotlarının bazı Silene L.  Caryophyllaceae taksonları üzerinde karşılaştırmalı analizi

Emre SEVİNDİK; Fatih COŞKUN; Selami SELVİ; Süheyla A ALKAÇ

Makale detayları

Genomik DNA izolasyon metotlarının bazı Silene L. Caryophyllaceae taksonları üzerinde karşılaştırmalı analizi

Yazarlar:

Emre SEVİNDİK | Fatih COŞKUN | Selami SELVİ | Süheyla A ALKAÇ

Yayıncı:

Ersin YÜCEL

Dergi:

Biological Diversity and Conservation 2013 Vol.6 Issue 3, pp.67-71

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

12/2013

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000893640

Sıklık:

Üç Yıllık

eISSN:

1308-8084

pISSN:

1308-5301

Anahtar kelimeler:

Özet:

 

In this study, genomic DNA isolation methods on six taxa belonging to two different sections of the aromatic plant genus Silene L.  Caryophyllaceae  were investigated. The gDNA isolation methods were investigated on two taxa from the section Brachypodeae Boiss.  S. leptoclada Boiss. and Silene balansae Boiss.  and four taxafrom the section Auriculatae Boiss.  S. araratica Schischk.subsp. araratica, S. lucida Chowdh.subsp. lucida, S. oligotricha Hub.-Mor. and S. caucasica Bunge Boiss. . During the study, Phenol-chloroform-isoamyl alcohol isolation procedure and Sigma DNA isolation commercial kit protocol were used. Purity and the amount of obtained gDNAs were determined via gel electrophoresis and spectrophotometry  A260/A280 . Based on the results of the taxa studied, Phenolchloroform-isoamyl alcohol isolation procedure was found as the method yielding the highest amount of the DNA as ng in 1 stock.

 

Bu çalışmada aromatik bitkilerden Silene L.  Caryophyllaceae  cinsinin iki farklı seksiyonuna ait altı taksonu üzerinde genomik DNA izolasyon metotları araştırılmıştır. Brachypodeae Boiss. seksiyonundan 2 takson  S. leptoclada Boiss. ve S. balansaeBoiss.  ve Auriculatae Boiss. seksiyonundan ise 4 takson üzerinde  S. araratica Schischk subsp. araratica, S. lucida Chowdh.subsp. lucida, S. oligotricha Hub.-Mor . ve S. caucasica Bunge Boiss.  genomik DNA izolasyon metotları araştırılmıştır. Çalışma süresince, Fenol-kloroform-izoamilalkol izolasyon protokolü ve ticarî DNA izolasyon kiti kullanılmıştır. Elde edilen genomik DNA örneklerinin miktarları ve saflık dereceleri jel elektroforezi ve spektrofotometre  A260 / A280  ölçümleriyle belirlenmiştir. Taksonlar üzerinde yapılan çalışmanın sonuçlarına göre, 1 µl stokda ng cinsinden en çok genomik DNA elde edilmesini sağlayan yöntemin Fenol-kloroformizoamilalkol olduğu görülmüştür.

Makale detayları

Genomik DNA izolasyon metotlarının bazı Silene L. Caryophyllaceae taksonları üzerinde karşılaştırmalı analizi

Yazarlar:

Emre SEVİNDİK | Fatih COŞKUN | Selami SELVİ | Süheyla A ALKAÇ

Yayıncı:

Ersin YÜCEL

Dergi:

Biological Diversity and Conservation 2013 Vol.6 Issue 3, pp.67-71

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

12/2013

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000893640

Sıklık:

Üç Yıllık

eISSN:

1308-8084

pISSN:

1308-5301

Genomik DNA izolasyonu

Silene

fenol-kloroform-izoamilalkol

ticari kit

Sayı

Makale detayları

Genomik DNA izolasyon metotlarının bazı Silene L. Caryophyllaceae taksonları üzerinde karşılaştırmalı analizi

Yazarlar: Emre SEVİNDİK | Fatih COŞKUN | Selami SELVİ | Süheyla A ALKAÇ

Yayıncı: Ersin YÜCEL

Dergi: Biological Diversity and Conservation 2013 Vol.6 Issue 3, pp.67-71

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 12/2013

Belge Dili: Türkçe

Document ID (Org No.): 2000893640

Sıklık: Üç Yıllık

eISSN: 1308-8084

pISSN: 1308-5301

Genomik DNA izolasyonu

Silene

fenol-kloroform-izoamilalkol

ticari kit

Sayı

Yazarlar:

Emre SEVİNDİK | Fatih COŞKUN | Selami SELVİ | Süheyla A ALKAÇ

Yayıncı:

Ersin YÜCEL

Dergi:

Biological Diversity and Conservation 2013 Vol.6 Issue 3, pp.67-71

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

12/2013

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000893640

Sıklık:

Üç Yıllık

eISSN:

1308-8084

pISSN:

1308-5301