Assessment of Genetic Diversity in Cucumber (Cucumis sativus L.) Genotypes Using Morphological Characters and AFLP Analysis

Yaşar KARAKURT; Damla GÜVERCİN; Sercan ÖNDER; Özgür İŞLER

doi:https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.583844

Makale detayları

Assessment of Genetic Diversity in Cucumber (Cucumis sativus L.) Genotypes Using Morphological Characters and AFLP Analysis

Yazarlar:

Yaşar KARAKURT | Damla GÜVERCİN | Sercan ÖNDER | Özgür İŞLER

Ana Başlıklar:

Üretim

Dergi:

Journal Of Agriculture and Nature 2020 Vol.23 Issue 3, pp.577-585

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

6/2020

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000502943

DOI:

https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.583844

Özet:

 


For
this purpose, 18 cucumber lines were
evaluated for their genetic diversity using six morphological characterizations
(plant morphology, plant length, length of leaf blade, fruit length, fruit
diameter and fruit stem length) and eight AFLP markers. These AFLP primer combinations
amplified well and also showed polymorphism. Thus, 1975 AFLP fragments were
obtained and 1468 fragments were polymorphic (75.34%). Dendrograms were drawn
using UPGMA (Unweighted Pair Group Method) arithmetical averages and according
to the UPGMA dendrogram, the cucumber accessions clustered into two main
groups. The genetic distances of the dendrogram varied between 0.92 and 0.96. Cluster analysis based on morphological
data discriminated all lines into three major clusters in UPGMA
dendrogram. The
similarity coefficient ranged between 0.888
and 0.982 indicating that the
cucumber lines used in the study have a low level of genetic variation. Results
obtained from the phylogenetic dendrogram by 8 pairs of AFLP primers were
consistent with those from the UPGMA clustering analysis, which were in
according with the morphological taxonomy on cucumber. 

.

 


Bu
çalışmanın amacı hıyar genotiplerinin morfolojik ve moleküler çeşitliliğini
değerlendirmektir. Bu amaçla, altı adet morfolojik özellik (bitki morfolojisi,
bitki boyu, yaprak ayası büyüklüğü, meyve uzunluğu, meyve çapı ve meyve sapı
uzunluğu) ve sekiz AFLP markeri kullanılarak 18 hıyar hattı genetik çeşitlilik
açısından değerlendirilmiştir. Kullanılan AFLP primer kombinasyonları
polimorfizm göstermiştir. Çalışma sonucunda 1975 AFLP fragmanı elde edilmiş ve
1468 fragmanın polimorfik olduğu görülmüştür (%75.34). Dendrogramlar, aritmetik
ortalamalar kullanılarak UPGMA (Unweighted Pair Group Method) yöntemiyle
çizilmiş ve UPGMA dendrogramına göre hıyar genotipleri iki ana gruba
ayrılmıştır. Dendrogramın genetik mesafeleri 0.92 ile 0.96 arasında
değişmiştir. Morfolojik verilere dayanan küme analizinde ise UPGMA dendrogramı
tüm hatları üç ana kümeye ayırmıştır. Çalışmada kullanılan hıyar hatlarının
benzerlik katsayısının 0.888 ile 0.982 arasında değişen düşük bir genetik
varyasyon seviyesine sahip olduğu belirlenmiştir. 8 çift AFLP primeri ile
oluşturulan filogenetik dendogramlarla, morfolojik taksonomi ile yapılan UPGMA
kümeleme analizleriyle oluşturulan dendogramlar örtüşmektedir.

.

Makale detayları

Assessment of Genetic Diversity in Cucumber (Cucumis sativus L.) Genotypes Using Morphological Characters and AFLP Analysis

Yazarlar: Yaşar KARAKURT | Damla GÜVERCİN | Sercan ÖNDER | Özgür İŞLER

Ana Başlıklar: Üretim

Dergi: Journal Of Agriculture and Nature 2020 Vol.23 Issue 3, pp.577-585

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 6/2020

Belge Dili: İngilizce

Document ID (Org No.): 2000502943

DOI: https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.583844

Sayı

Yazarlar:

Yaşar KARAKURT | Damla GÜVERCİN | Sercan ÖNDER | Özgür İŞLER

Ana Başlıklar:

Üretim

Dergi:

Journal Of Agriculture and Nature 2020 Vol.23 Issue 3, pp.577-585

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

6/2020

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000502943

DOI:

https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.583844