The genomic DNA isolation methods comparative analysis upon some Sideritis   Labiateae  and Serratula   Asteraceae  taxa

A DURAN; Fatih COŞKUN; Nur Gökçe ÇETİNER; Selami SELVİ; Necla ŞAHİN

Makale detayları

The genomic DNA isolation methods comparative analysis upon some Sideritis Labiateae and Serratula Asteraceae taxa

Yazarlar:

A DURAN | Fatih COŞKUN | Nur Gökçe ÇETİNER | Selami SELVİ | Necla ŞAHİN

Yayıncı:

Ersin YÜCEL

Dergi:

Biological Diversity and Conservation 2013 Vol.6 Issue 2, pp.16-21

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

4/2013

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000893691

Sıklık:

Üç Yıllık

eISSN:

1308-8084

pISSN:

1308-5301

Anahtar kelimeler:

Özet:

 

There are different protocols for DNA isolation from plants. Due to variation in chemical composition of plants, different DNA isolation methods may be necessary for closely related species. In this study, some species belonging to aromatic plant genus Sideritis L.  Sideritis vulcanica Hub.-Mor., Sideritis montana L. subsp. montana, Sideritis gulendamiae H. Duman et Karavelioğulları, Sideritis congesta P.H. Davis et Hub.-Mor. and Sideritis tmolea P.H. Davis  and some species belonging to the genus Serratula L.  Serratula bornmuelleri Azn, Serratula haussknechtii Boiss., Serratula serratuloides  DC  Takht., and Serratula hakkiarica P.H. Davis  were used. The methods used in this investigation included Phenol-chloroform-isoamyl alcohol isolation procedure, CTAB DNA isolation procedure, and procedure from a commercial kit. Purity and the amount of obtained gDNAs were determined via gel electrophoresis and spectrophotometry  A260/A280 . Analysis of the results suggested that the CTAB method was the most appropriate for genomic DNA isolation from the taxa in question, to obtain the greatest amount in 1 µl stock solution as the ng amount.

 

Bitkilerden genomik DNA izolasyonu için farklı izolasyon metotlar bulunmaktadır. Bitkilerin kimyasal içerikleri farklı olduğundan birbirine yakın türler için bile farklı DNA izolasyon yöntemleri gerekebilir. Bu çalışmada aromatik bitkilerden Sideritis L. cinsine ait bazı taksonlar  Sideritis vulcanica Hub.-Mor., Sideritis montana L. subsp. montana, Sideritis gulendamiae H. Duman et Karavelioğulları, Sideritis congesta P.H. Davis et Hub.-Mor. ve Sideritis tmolea P.H. Davis  ile Serratula L. cinsine ait bazı taksonlar  Serratula bornmuelleri Azn, Serratula haussknechtii Boiss., Serratula serratuloides  DC  Takht. ve Serratula hakkiarica P.H. Davis,  kullanılmıştır. Bu çalışmada fenolchloroform-izoamil alkol izolasyon protokolü, CTAB protokolü ve ticarî DNA izolasyon kiti  Sigma, Almanya  kullanılmıştır. Elde edilen gDNA örneklerinin miktarları ve saflık dereceleri jel elektroforezi ve spektrofotometre  A260 / A280  ölçümleriyle belirlenmiştir. Taksonlar üzerinde yapılan çalışmanın sonuçlarına göre, 1 µl stokda ng cinsinden en çok DNA elde edilmesini sağlayan yöntemin CTAB olduğu görülmüştür.

Makale detayları

The genomic DNA isolation methods comparative analysis upon some Sideritis Labiateae and Serratula Asteraceae taxa

Yazarlar:

A DURAN | Fatih COŞKUN | Nur Gökçe ÇETİNER | Selami SELVİ | Necla ŞAHİN

Yayıncı:

Ersin YÜCEL

Dergi:

Biological Diversity and Conservation 2013 Vol.6 Issue 2, pp.16-21

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

4/2013

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000893691

Sıklık:

Üç Yıllık

eISSN:

1308-8084

pISSN:

1308-5301

genomik DNA izolasyonu

PCR

Sideritis

Serratula

Sayı

Makale detayları

The genomic DNA isolation methods comparative analysis upon some Sideritis Labiateae and Serratula Asteraceae taxa

Yazarlar: A DURAN | Fatih COŞKUN | Nur Gökçe ÇETİNER | Selami SELVİ | Necla ŞAHİN

Yayıncı: Ersin YÜCEL

Dergi: Biological Diversity and Conservation 2013 Vol.6 Issue 2, pp.16-21

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 4/2013

Belge Dili: İngilizce

Document ID (Org No.): 2000893691

Sıklık: Üç Yıllık

eISSN: 1308-8084

pISSN: 1308-5301

genomik DNA izolasyonu

PCR

Sideritis

Serratula

Sayı

Yazarlar:

A DURAN | Fatih COŞKUN | Nur Gökçe ÇETİNER | Selami SELVİ | Necla ŞAHİN

Yayıncı:

Ersin YÜCEL

Dergi:

Biological Diversity and Conservation 2013 Vol.6 Issue 2, pp.16-21

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

4/2013

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000893691

Sıklık:

Üç Yıllık

eISSN:

1308-8084

pISSN:

1308-5301