HT29 Hücre Hattında Sirkadiyen Ritme Bağlı Gen İfadesinin Kontrolünde Referans Gen Farklılığının Senkronizasyondaki Rolü

Beyza GÖNCÜ; Dilek ÖZTÜRK

Makale detayları

HT29 Hücre Hattında Sirkadiyen Ritme Bağlı Gen İfadesinin Kontrolünde Referans Gen Farklılığının Senkronizasyondaki Rolü

Yazarlar:

Beyza GÖNCÜ | Dilek ÖZTÜRK

Yayıncı:

Erzincan Binali Yildirim University

Ana Başlıklar:

Uygulamalı fizik

Dergi:

Erzincan University Journal of Science and Technology 2019 Vol.12 Issue 3, pp.1370-1380

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

12/2019

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000414730

eISSN:

2149-4584

pISSN:

1307-9085

Özet:

 

Sirkadiyen
zamanlama sistemi, memeli organ ve hücrelerinde bulunan moleküler saatler
aracılığı ile pek çok hayati fonksiyonu kontrol etmektedir. Son yıllarda
yapılan çalışmalar ile sirkadiyen ritmin hastalıklardaki rolü daha iyi
anlaşılmıştır. Bu kapsamda gerçekleştirilecek hücre kültürü çalışmalarında
öncelikli olarak senkronizasyonun sağlanması ve kontrolü önem arz etmektedir.
Sunduğumuz çalışmada besin aracılığı ile senkronize edilen HT-29 hücrelerinde,
senkronizasyon saat geni olarak da bilinen PER2
ve iki farklı referans gen ile kontrol edilmiştir. Amacımız senkronizasyon
kontrolünde referans genlerin rolünü incelemektir. Bu amaçla; serum şokunu
takiben HT-29 hücreleri T0 zamanından itibaren 6 farklı zamanda toplanarak RNA
izole edilmiş ve PER2, ACTB ve RPLP0 gen ekspresyonları gerçek zamanlı PZR (RT-PZR) deneyi ile
kantifiye edilmiştir. Sonuçlar Fourier transformasyon ve Lineer Cosinor
analizleri ile değerlendirilmiştir. ACTB
referans geni seçildiğinde Fourier transformasyon analizi ile 24 ve 30 saatlik
periyotlar anlamlı değişim gösterirken, Lineer Cosinor analizi ile sadece 24
saatlik periyot süresi anlamlı değişim göstermiştir. RPLP0 referans geni seçildiğinde her iki analiz ile de 18 saatlik
periyot süresi anlamlılık göstermiştir. Bulguların gösterdiği gibi
senkronizasyonun başlatılması ve kontrolünde referans gen ve analiz yöntemi
gibi pek çok parametrenin birlikte değerlendirilmesi önem arz etmektedir.
Yapılan çalışmanın bu alanda yapılacak in vitro çalışmalar için
farkındalık yaratacağı düşünülmektedir. .

Makale detayları

HT29 Hücre Hattında Sirkadiyen Ritme Bağlı Gen İfadesinin Kontrolünde Referans Gen Farklılığının Senkronizasyondaki Rolü

Yazarlar: Beyza GÖNCÜ | Dilek ÖZTÜRK

Yayıncı: Erzincan Binali Yildirim University

Ana Başlıklar: Uygulamalı fizik

Dergi: Erzincan University Journal of Science and Technology 2019 Vol.12 Issue 3, pp.1370-1380

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 12/2019

Belge Dili: Türkçe

Document ID (Org No.): 2000414730

eISSN: 2149-4584

pISSN: 1307-9085

Sayı

Yazarlar:

Beyza GÖNCÜ | Dilek ÖZTÜRK

Yayıncı:

Erzincan Binali Yildirim University

Ana Başlıklar:

Uygulamalı fizik

Dergi:

Erzincan University Journal of Science and Technology 2019 Vol.12 Issue 3, pp.1370-1380

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

12/2019

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000414730

eISSN:

2149-4584

pISSN:

1307-9085