Identification and Antimicrobial Activity of Actinobacteria Isolated from Rhizosphere of the Local Endemic Plants

Süleyman ÖZAKIN; Bilgin TAŞKIN; Ebru İNCE BOSTANCI

doi:https://doi.org/10.29133/yyutbd.957756

Makale detayları

Identification and Antimicrobial Activity of Actinobacteria Isolated from Rhizosphere of the Local Endemic Plants

Yazarlar:

Süleyman ÖZAKIN | Bilgin TAŞKIN | Ebru İNCE BOSTANCI

Yayıncı:

Van Yuzuncu Yıl University

Ana Başlıklar:

Üretim | Tarım

Dergi:

Yuzuncu Yıl University Journal of Agricultural Sciences 2021 Vol.31 Issue 4, pp.876-885

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

12/2021

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000650382

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

1308-7584

pISSN:

1308-7576

DOI:

https://doi.org/10.29133/yyutbd.957756

Özet:

 

The search for novel antimicrobial compounds from the environment has been gaining momentum with the increase in resistance of pathogens.  In the present study, the antimicrobial potential of 11 local isolates of Actinobacteria which were isolated from rhizosphere soils of the three local endemic plants in Turkey was evaluated against different pathogenic bacteria and Candida albicans. Antimicrobial activity was investigated by the disk diffusion agar method using the organic extracts obtained from the isolates grown in the modified Bennett's medium and Tryptic Soy Broth (TSB). Eight isolates were revealed to show remarkable antimicrobial activity against to pathogens. Study of the production of bioactive metabolites in two different culture media indicated that the higher antimicrobial activity was observed in modified Bennett's medium when compared to TSB. Also, partial 16S rDNA sequence analyses revealed that 10 of these local isolates belong to member of Streptomyces and one of them to member Promicromonospora genera.

 

Patojenlerin direncinin artmasıyla birlikte yeni antimikrobiyal bileşik arayışı hız kazanmaktadır. Bu çalışmada, Türkiye'deki üç yerel endemik bitkinin rizosfer topraklarından izole edilen 11 lokal Aktinobakteri izolatının farklı patojen bakterilere ve Candida albicans'a karşı antimikrobiyal potansiyeli değerlendirilmiştir. In vitro antimikrobiyal aktivite, modifiye Bennett's ve Tryptic Soy Broth (TSB) besiyerinde üretilen izolatların organik özütleri kullanılarak disk difüzyon agar yöntemiyle araştırılmıştır. Sekiz izolatın patojenlere karşı kayda değer antimikrobiyal aktiviteye sahip olduğu belirlenmiştir. Biyoaktif metabolitlerin üretimi üzerine iki farklı kültür ortamının incelenmesi sonucu, modifiye Bennett ortamında daha yüksek antimikrobiyal aktivitenin elde edildiği bulunmuştur. Ayrıca kısmi 16S rDNA dizi analizleri ile bu lokal suşların 10'unun Streptomyces ve birinin de Promicromonospora cinsine ait olduğu tespit edilmiştir.

Makale detayları

Identification and Antimicrobial Activity of Actinobacteria Isolated from Rhizosphere of the Local Endemic Plants

Yazarlar: Süleyman ÖZAKIN | Bilgin TAŞKIN | Ebru İNCE BOSTANCI

Yayıncı: Van Yuzuncu Yıl University

Ana Başlıklar: Üretim | Tarım

Dergi: Yuzuncu Yıl University Journal of Agricultural Sciences 2021 Vol.31 Issue 4, pp.876-885

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 12/2021

Belge Dili: İngilizce

Document ID (Org No.): 2000650382

Sıklık: Üç Aylık

eISSN: 1308-7584

pISSN: 1308-7576

DOI: https://doi.org/10.29133/yyutbd.957756

Sayı

Yazarlar:

Süleyman ÖZAKIN | Bilgin TAŞKIN | Ebru İNCE BOSTANCI

Yayıncı:

Van Yuzuncu Yıl University

Ana Başlıklar:

Üretim | Tarım

Dergi:

Yuzuncu Yıl University Journal of Agricultural Sciences 2021 Vol.31 Issue 4, pp.876-885

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

12/2021

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000650382

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

1308-7584

pISSN:

1308-7576

DOI:

https://doi.org/10.29133/yyutbd.957756