Bazı altıntop (Citrus paradisi) ve adak şadoklarda (Citrus maxima) genetik akrabalık ve farklılıklarının SSR markırlarıyla tanımlanması

İ. POLAT; E. TURGUTOĞLU

Makale detayları

Bazı altıntop (Citrus paradisi) ve adak şadoklarda (Citrus maxima) genetik akrabalık ve farklılıklarının SSR markırlarıyla tanımlanması

Yazarlar:

İ. POLAT | E. TURGUTOĞLU

Yayıncı:

Akdeniz University

Ana Başlıklar:

Tarım

Dergi:

Akdeniz University Journal of the Faculty of Agriculture 2012 Vol.25 Issue 1, pp.1-7

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

5/2012

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000546122

Sıklık:

Üç Yıllık

eISSN:

2528-9675

Özet:

 


In this study, genetic relationship and diversity were determined by SSR (simple sequence repeat) markers among thirty grapefruits (Citrus paradisi Macf.), one Citrus hassaku and five pummello [(Citrus maxima (Burm.) Merr.)] accessions derived from selections and introduction. Of the 26 SSR primers used produced fifteen polymorphic fragments. Genetic relationship and distance were determined by using UPGMA (unweighted-pair group method arithmetic average) dendrogram and PCA (principal component analysis) analysis. The Dice (1945)’s similarity coefficient among grapefruit and pummello accessions ranged from 0.60 to 0.97 and matrix correlation (r) was 0.88. The analyses showed that there was 97% genetic similarity in terms of primers investigated between Foster B 6/5 28-12 and Ray Ruby grapefruit.  On the contrary, Red Şadok with 60% of genetic similarity was the farthest among 36 accessions. All pummelos were took place within one group. But, some grapefruits also nested in the pummelos group. This result may be due to the grapefruits are natural hybrid between pummelo and sweet orange. Genetic variation was quite low in some grapefruit accessions. Similarity-based analyses supported the theory of grapefruits are of nucellar origin.

.

 

Seleksiyon ve introduksiyon yoluyla elde edilmiş 30 adet altıntop (Citrus paradisi Macf.), 1
 adet Citrus hassaku ve 5 adet şadok [Citrus maxima (Burm.) Merr.)]‟un genetik farklılığı ve
 birbiriyle olan genetik yakınlığını belirlemek amacıyla SSR (simple sequence repeat) moleküler
 markır tekniği kullanılmıştır. Çalışmada kullanılan 26 adet SSR primerinden 15 tanesi
 polimorfizm sağlamıştır. UPGMA (unweighted-pair group method aritmetic average)
 dendrogram ve PCA (principal component analysis) analizleri sonucu bireylerin birbirleriyle
 olan genetik yakınlıkları ve uzaklıkları belirlenmiştir. Dice (1945)‟ın benzerlik katsayısına göre
 benzerlik oranları 0,60-0,97 arasında değişim göstermiş, matrix korelosyonu (r) 0,88 olarak
 bulunmuştur. Değerlendirme sonucunda, Foster B 6/5 28-12 ile Ray Ruby altıntopu arasında
 incelenen primerlere göre % 97 oranında bir benzerlik olduğu saptanmış, Red Şadok ise % 60
 oranıyla en uzak bireyi oluşturmuştur. Çalışmada kullanılan tüm şadoklar bir grup içerisinde
 yer almıştır. Buna karşın şadok grubu içerisinde bazı altıntopların da yer aldığı belirlenmiştir.
 Bu durumun altıntopların şadok ile portakal melezi olmasından kaynaklanabileceği
 değerlendirilmiştir. Bazı altıntoplarda ise genetik yakınlık oldukça fazladır. Düşük varyasyon
 göstermesinin sebebi, altıntopların mutasyon orijinli olmasından kaynaklanabilir.

Makale detayları

Bazı altıntop (Citrus paradisi) ve adak şadoklarda (Citrus maxima) genetik akrabalık ve farklılıklarının SSR markırlarıyla tanımlanması

Yazarlar: İ. POLAT | E. TURGUTOĞLU

Yayıncı: Akdeniz University

Ana Başlıklar: Tarım

Dergi: Akdeniz University Journal of the Faculty of Agriculture 2012 Vol.25 Issue 1, pp.1-7

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 5/2012

Belge Dili: Türkçe

Document ID (Org No.): 2000546122

Sıklık: Üç Yıllık

eISSN: 2528-9675

Sayı

Yazarlar:

İ. POLAT | E. TURGUTOĞLU

Yayıncı:

Akdeniz University

Ana Başlıklar:

Tarım

Dergi:

Akdeniz University Journal of the Faculty of Agriculture 2012 Vol.25 Issue 1, pp.1-7

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

5/2012

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000546122

Sıklık:

Üç Yıllık

eISSN:

2528-9675