Evaluation of Some Carob (Ceratonia siliqua L.) Genotypes in Silifke (Mersin, Turkey) Province by Cluster Analysis

Saim BOSTAN; Yeliz KAŞKO ARICI

Makale detayları

Evaluation of Some Carob (Ceratonia siliqua L.) Genotypes in Silifke (Mersin, Turkey) Province by Cluster Analysis

Yazarlar:

Saim BOSTAN | Yeliz KAŞKO ARICI

Yayıncı:

Gıda, Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı

Dergi:

Fruit Science 2015 Vol.2 Issue 1, pp.35-41

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

1/2015

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000563513

Sıklık:

İki Yıllık

eISSN:

2148-8770

Özet:

 


This study was aimed to the evaluation of some carob (Ceratonia siliqua L.) genotypes by cluster analysis. In this study, the fruits harvested from 17 wild carob genotypes were evaluated in 2011 and 2012 years in Silifke (Mersin, Turkey). In these genotypes, pod weight, pod length, pod width, pod thickness, fruit stalk length, fruit stalk thickness, seed number, seed weight, pulp ratio, seed width, seed length, seed thickness, leaf width, leaf length, leaf petiole length, leaf petiole thickness, total soluble solids, pH and titratable acidity were determined. Relationship among these characters of the carob genotypes was analyzed by Principal Component Analysis (PCA) and Hierarchical Cluster analysis (HCA). Single linkage (SLINK) technique and Euclidean distance were used for clustering. Clusters in the cluster dendrogram were identified based on similarities. The dendrogram obtained from HCA showed that these genotypes of carob were collected in 5 clusters. According to HCA, 17 carob genotypes were similar in rates ranging from 46% to 89%. While the highest similarity was found between 1 and 16 genotypes, the most distant genotype was 8. Cluster I consisted of 1, 3, 4, 9, 11, 13, 14, 15 and 16 genotypes. 5, 7 and 17 were placed in cluster II; 10 and 12 were placed in cluster III; 2 and 6 were placed in cluster IV. Genotype 8 was considered as singular.

Key Words: Carob, Ceratonia siliqua, cluster analysis, principal component analysis, genotype

Silifke'de (Mersin, Türkiye) Yetişen Bazı Keçiboynuzu (Ceratonia siliqua L.) Genotiplerinin Kümeleme Analizi ile Değerlendirilmesi

 

Bu çalışma, bazı keçiboynuzu (Ceratonia siliqua L.) genotiplerinin kümeleme analizi ile değerlendirilmesi amacıyla yürütülmüştür. Çalışmada 2011 ve 2012 yıllarında, Silifke (Mersin, Türkiye) ilçesinde doğal olarak yetişmekte olan 17 genotipten hasat edilen meyveler değerlendirilmiştir. Genotiplerde meyve ağırlığı, meyve boyu, meyve eni, meyve kalınlığı, meyve sapı uzunluğu, meyve sapı kalınlığı, tohum sayısı, tohum ağırlığı, meyve eti oranı, tohum eni, tohum boyu, tohum kalınlığı, yaprak eni, yaprak boyu, yaprak sapı uzunluğu, yaprak sapı kalınlığı, suda çözünür kuru madde miktarı, pH ve titre edilebilir asitlik özellikleri belirlenmiştir. Genotiplerin bu özellikleri arasındaki ilişkiler, temel bileşenler analizi ve hiyerarşik kümeleme analizi (HKA) ile analiz edilmiştir. Kümelemede tek bağlantı tekniği (SLINK) ve öklit uzaklığı kullanılmıştır. Küme dendogramındaki kümeler, benzerliklerine göre tanımlanmıştır. HKA sonucunda elde edilen dendogram, keçiboynuzu genotiplerinin 5 kümede toplandığını göstermiştir. HCA’ya göre 17 genotip %46’dan %89’a değişen oranlarda benzer bulunmuştur. En yüksek benzerlik, 1 ve 16 numaralı genotipler arasında bulunurken en uzak, 8 numaralı genotip olmuştur. I. küme 1, 3, 4, 9, 11, 13, 14, 15 ve 16 numaralı genotiplerden oluşmuştur. 5, 7 ve 17 II. kümeye, 10 ve 12 III. kümeye yerleşirken 2 ve 6 IV. kümeye yerleşmiştir. 8 numaralı genotip ise tekil olarak kümelenmiştir.

Anahtar Kelimeler: Keçiboynuzu, Ceratonia siliqua, kümeleme analizi, temel bileşenler analizi, genotip

 

.

 

Bu çalışma, bazı keçiboynuzu (Ceratonia siliqua L.) genotiplerinin kümeleme analizi ile değerlendirilmesi amacıyla yürütülmüştür. Çalışmada 2011 ve 2012 yıllarında, Silifke (Mersin, Türkiye) ilçesinde doğal olarak yetişmekte olan 17 genotipten hasat edilen meyveler değerlendirilmiştir. Genotiplerde meyve ağırlığı, meyve boyu, meyve eni, meyve kalınlığı, meyve sapı uzunluğu, meyve sapı kalınlığı, tohum sayısı, tohum ağırlığı, meyve eti oranı, tohum eni, tohum boyu, tohum kalınlığı, yaprak eni, yaprak boyu, yaprak sapı uzunluğu, yaprak sapı kalınlığı, suda çözünür kuru madde miktarı, pH ve titre edilebilir asitlik özellikleri belirlenmiştir. Genotiplerin bu özellikleri arasındaki ilişkiler, temel bileşenler analizi ve hiyerarşik kümeleme analizi (HKA) ile analiz edilmiştir. Kümelemede tek bağlantı tekniği (SLINK) ve öklit uzaklığı kullanılmıştır. Küme dendogramındaki kümeler, benzerliklerine göre tanımlanmıştır. HKA sonucunda elde edilen dendogram, keçiboynuzu genotiplerinin 5 kümede toplandığını göstermiştir. HCA’ya göre 17 genotip %46’dan %89’a değişen oranlarda benzer bulunmuştur. En yüksek benzerlik, 1 ve 16 numaralı genotipler arasında bulunurken en uzak, 8 numaralı genotip olmuştur. I. küme 1, 3, 4, 9, 11, 13, 14, 15 ve 16 numaralı genotiplerden oluşmuştur. 5, 7 ve 17 II. kümeye, 10 ve 12 III. kümeye yerleşirken 2 ve 6 IV. kümeye yerleşmiştir. 8 numaralı genotip ise tekil olarak kümelenmiştir.

Makale detayları

Evaluation of Some Carob (Ceratonia siliqua L.) Genotypes in Silifke (Mersin, Turkey) Province by Cluster Analysis

Yazarlar: Saim BOSTAN | Yeliz KAŞKO ARICI

Yayıncı: Gıda, Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı

Dergi: Fruit Science 2015 Vol.2 Issue 1, pp.35-41

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 1/2015

Belge Dili: İngilizce

Document ID (Org No.): 2000563513

Sıklık: İki Yıllık

eISSN: 2148-8770

Sayı

Yazarlar:

Saim BOSTAN | Yeliz KAŞKO ARICI

Yayıncı:

Gıda, Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı

Dergi:

Fruit Science 2015 Vol.2 Issue 1, pp.35-41

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

1/2015

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000563513

Sıklık:

İki Yıllık

eISSN:

2148-8770