ISPARTA İLİNDE AKUT SOLUNUM YOLU ENFEKSİYONU ÖN TANISI OLAN HASTALARDA MULTİPLEKS PCR YÖNTEMİYLE VİRAL VE BAKTERİYEL ETKENLERİN SIKLIĞININ ARAŞTIRILMASI

Mümtaz Cem ŞİRİN

Makale detayları

ISPARTA İLİNDE AKUT SOLUNUM YOLU ENFEKSİYONU ÖN TANISI OLAN HASTALARDA MULTİPLEKS PCR YÖNTEMİYLE VİRAL VE BAKTERİYEL ETKENLERİN SIKLIĞININ ARAŞTIRILMASI

Yazarlar:

Mümtaz Cem ŞİRİN

Yayıncı:

Süleyman Demirel University

Ana Başlıklar:

Hastalıklar

Dergi:

SDU Medical Faculty Journal 2022 Vol.29 Issue 2, pp.171-178

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

6/2022

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000571888

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

2602-2109

pISSN:

1300-7416

Özet:

 

Objective
Respiratory tract infections are among the most
common diseases in all age groups, and the
prevalence and seasonal distribution of the agents
may differ between geographical regions. This study
aimed to determine the prevalence and seasonal
distribution of respiratory tract agents in patients
admitted to Süleyman Demirel University Research
and Practice Hospital.
Material and Methods
Respiratory tract samples sent to the Medical
Microbiology Laboratory from patients with a prediagnosis
of acute respiratory tract infection between
January 1, 2019 and December 31, 2019 were
investigated for the presence of viral and bacterial
agents by multiplex real-time polymerase chain reaction
(MRT-PCR) method (FTD Respiratory Pathogens
21 plus, Fast Track Diagnostics, Luxembourg). The
results of a total of 120 patients, 20 children and 100
adults, were analyzed retrospectively.
Results
One or more agent positivity was detected in 71
(59.2%) of the samples, while no agent was detected
in 49 (40.8%) of the samples. Positivity was detected
in 9 (45%) of the pediatric patients and 62 (62%) of the
adults. The most common viral and bacterial agents
causing infection were determined as rhinovirus
and Streptococcus pneumoniae, respectively.
While rhinovirus (n=20) and S.pneumoniae (n=16)
were detected throughout the year, it was observed
that coronaviruses (n=15) caused infection more
frequently in winter and spring months, influenza
viruses (n=9) and respiratory syncytial virus (RSV)
A/B (n=8) in winter months.
Conclusion
In this study, which is the first research conducted in
our province for the identification of respiratory tract
pathogens by molecular methods, the most common
agents in children and adults were found to be RSV
A/B and rhinovirus, respectively. Simultaneous, rapid
and sensitive detection of viral and bacterial agents
responsible for respiratory tract infections by MRTPCR
method will guide clinicians in terms of preventing
unnecessary antibiotic use and infection control.

 

Amaç
Solunum yolu enfeksiyonları, tüm yaş gruplarında en
sık karşılaşılan hastalıklardan olup etkenlerin görülme
sıklığı ve mevsimsel dağılımı coğrafi bölgeler arasında
farklılıklar gösterebilmektedir. Bu çalışmada, Süleyman
Demirel Üniversitesi Araştırma ve Uygulama
Hastanesi’ne başvuran hastalarda solunum yolu etkenlerinin
prevalansı ve mevsimsel dağılımının belirlenmesi
amaçlanmıştır.
Gereç ve Yöntem
Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na 1 Ocak 2019-31
Aralık 2019 tarihleri arasında akut solunum yolu enfeksiyonu
ön tanısı alan hastalardan gönderilen solunum
yolu örnekleri, multipleks gerçek zamanlı polimeraz
zincir reaksiyonu (MRT-PCR) yöntemi (FTD
Respiratory Pathogens 21 plus, Fast Track Diagnostics,
Luxembourg) ile viral ve bakteriyel etkenlerin varlığı
açısından araştırıldı. Yirmisi çocuk, 100’ü erişkin
toplam 120 hastanın sonuçları retrospektif olarak incelendi.
Bulgular
Örneklerin 71 (%59.2)’inde bir veya birden fazla etken
pozitifliği saptanırken, 49 (%40.8)’unda etken
saptanmadı. Çocuk hastaların 9’unda (%45), erişkinlerin
62’sinde (%62) pozitiflik saptandı. Enfeksiyona
en sık yol açan viral ve bakteriyel etkenler sırasıyla
rinovirüs ve Streptococcus pneumoniae olarak belirlendi.
Rinovirüs (n=20) ve S.pneumoniae (n=16) yıl
boyunca saptanırken, koronavirüslerin (n=15) kış ve
ilkbahar aylarında, influenza virüsleri (n=9) ve solunum
sinsityal virüs (RSV) A/B’nin (n=8) kış aylarında
daha sıklıkla enfeksiyona neden oldukları gözlendi.
Sonuç
Solunum yolu patojenlerinin moleküler yöntemlerle
tanımlanmasına yönelik ilimizde yapılan ilk araştırma
özelliğini taşıyan bu çalışmada, çocuklarda ve erişkinlerde
en sık saptanan etkenlerin sırasıyla RSV A/B
ve rinovirüs olduğu görülmüştür. Solunum yolu enfeksiyonlarından
sorumlu viral ve bakteriyel etkenlerin MRT-PCR yöntemiyle eş zamanlı, 
hızlı ve duyarlı bir şekilde tespiti, gereksiz antibiyotik kullanımının önlen-
multipmesi ve enfeksiyon kontrolü açısından klinisyenlere
yol gösterici olacaktır.

Makale detayları

ISPARTA İLİNDE AKUT SOLUNUM YOLU ENFEKSİYONU ÖN TANISI OLAN HASTALARDA MULTİPLEKS PCR YÖNTEMİYLE VİRAL VE BAKTERİYEL ETKENLERİN SIKLIĞININ ARAŞTIRILMASI

Yazarlar: Mümtaz Cem ŞİRİN

Yayıncı: Süleyman Demirel University

Ana Başlıklar: Hastalıklar

Dergi: SDU Medical Faculty Journal 2022 Vol.29 Issue 2, pp.171-178

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 6/2022

Belge Dili: Türkçe

Document ID (Org No.): 2000571888

Sıklık: Üç Aylık

eISSN: 2602-2109

pISSN: 1300-7416

Sayı

Yazarlar:

Mümtaz Cem ŞİRİN

Yayıncı:

Süleyman Demirel University

Ana Başlıklar:

Hastalıklar

Dergi:

SDU Medical Faculty Journal 2022 Vol.29 Issue 2, pp.171-178

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

6/2022

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000571888

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

2602-2109

pISSN:

1300-7416