Relationships among some endemic Hieracium L. s.str.  Asteraceae  taxa based on internal transcribed spacer  ITS

Mutlu GÜLTEPE; Kamil COŞKUNÇELEBI; Ali Osman BELDÜZ; Uğur UZUNER

Makale detayları

Relationships among some endemic Hieracium L. s.str. Asteraceae taxa based on internal transcribed spacer ITS

Yazarlar:

Mutlu GÜLTEPE | Kamil COŞKUNÇELEBI | Ali Osman BELDÜZ | Uğur UZUNER

Yayıncı:

Ersin YÜCEL

Dergi:

Biological Diversity and Conservation 2013 Vol.6 Issue 2, pp.134-141

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

4/2013

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000893733

Sıklık:

Üç Yıllık

eISSN:

1308-8084

pISSN:

1308-5301

Anahtar kelimeler:

Özet:

 

In the current study, thirteen individuals from ten endemic Hieracium  Asteraceae  taxa were analyzed by using sequences of the internal transcribed spacers  ITS  of nuclear ribosomal DNA in order to see whether the ITS could provide additional useful information for the relationships of the genus or not. Therefore, total genomic DNA was isolated from healthy leaves of each individual collected from different localities of North-east  NE  Anatolia  Turkey . Amplification of the entire ITS region was performed by using universal primers with the aid of the polymerase chain reaction  PCR . Neighbor Joining  NJ  and Maximum Parsimony  MP  trees were constructed based on the ITS sequences to elucidate the phylogenetic relationships among the investigated taxa. The aligned sequences comprised 710 characters. Divergence values among the individuals ranged from 0.0 to 2.1%. The ITS data provided sufficient variation to resolve interspecific relationships, but the topologies of the NJ and MP trees did not support conventional subgeneric classification of the species.

 

Bu çalışmada, 10 endemik Hieracium L. taksonuna ait 13 farklı birey, nüklear ribozomal DNA ITS bölgesinin cinsin akarabalık ilişkilerini ortaya koyabilecek yeni bilgiler sağlayıp sağlayamayacağını belirlemek amacıyla karşılaştırılmıştır. Bunun için öncelikle Kuzey Doğu Anadolu Bölgesi’nin değişik yerlerinden toplanan bireylerin sağlıklı yapraklarından genomik DNA’ları elde edilmiştir. Evrensel oligonükleotidler kullanılarak bireylere ait ITS bölgeleri polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılmıştır. Taksonlar arasındaki filogenetik ilişkiyi ortaya çıkarmak için Neighbour-Joining  NJ  ve Maksimum Parsimoni  MP  ağaçları çizilmiştir. Baz dizinlerinin hizalanması sonucu 710 karakterden oluşan bir veri seti elde edilmiş ve örnekler arasındaki divergens değerlerinin % 0.0-2.1 arasında değiştiği bulunmuştur. ITS bölgesi taksonlar arasındaki ilişkiyi açıklama da yeterli bilgi sağlamasına rağmen analiz sonucu elde edilen NJ ve MP ağaçlarının topolojileri, cinsin seri seviyesinde geleneksel taksonomik verileriyle uyum göstermemiştir.

Makale detayları

Relationships among some endemic Hieracium L. s.str. Asteraceae taxa based on internal transcribed spacer ITS

Yazarlar:

Mutlu GÜLTEPE | Kamil COŞKUNÇELEBI | Ali Osman BELDÜZ | Uğur UZUNER

Yayıncı:

Ersin YÜCEL

Dergi:

Biological Diversity and Conservation 2013 Vol.6 Issue 2, pp.134-141

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

4/2013

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000893733

Sıklık:

Üç Yıllık

eISSN:

1308-8084

pISSN:

1308-5301

Asteraceae

Hieracium

ITS

nrDNA

Türkiye

Sayı

Makale detayları

Relationships among some endemic Hieracium L. s.str. Asteraceae taxa based on internal transcribed spacer ITS

Yazarlar: Mutlu GÜLTEPE | Kamil COŞKUNÇELEBI | Ali Osman BELDÜZ | Uğur UZUNER

Yayıncı: Ersin YÜCEL

Dergi: Biological Diversity and Conservation 2013 Vol.6 Issue 2, pp.134-141

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 4/2013

Belge Dili: İngilizce

Document ID (Org No.): 2000893733

Sıklık: Üç Yıllık

eISSN: 1308-8084

pISSN: 1308-5301

Asteraceae

Hieracium

ITS

nrDNA

Türkiye

Sayı

Yazarlar:

Mutlu GÜLTEPE | Kamil COŞKUNÇELEBI | Ali Osman BELDÜZ | Uğur UZUNER

Yayıncı:

Ersin YÜCEL

Dergi:

Biological Diversity and Conservation 2013 Vol.6 Issue 2, pp.134-141

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

4/2013

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000893733

Sıklık:

Üç Yıllık

eISSN:

1308-8084

pISSN:

1308-5301