A Brief Reconnoitre about Effects of MMP9 on Aortic Dissection

Burcu SALMAN YAYLAZ; Melda SARIMAN; Ahmet EKMEKÇİ; Emel ERGÜL; Mahmut ULUGANYAN; Fulya COŞAN; Özgün Melike TOTUK GEDAR; Neslihan ABACI

doi:https://doi.org/10.26650/experimed.2021.874159

Makale detayları

A Brief Reconnoitre about Effects of MMP9 on Aortic Dissection

Yazarlar:

Burcu SALMAN YAYLAZ | Melda SARIMAN | Ahmet EKMEKÇİ | Emel ERGÜL | Mahmut ULUGANYAN | Fulya COŞAN | Özgün Melike TOTUK GEDAR | Neslihan ABACI

Yayıncı:

Istanbul University

Ana Başlıklar:

Hastalıklar

Dergi:

Experimed 2021 Vol.11 Issue 1, pp.12-20

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

5/2021

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000428921

eISSN:

2667-5846

DOI:

https://doi.org/10.26650/experimed.2021.874159

Özet:

 


Objective: Matrix metalloproteinases (MMPs) are the extracellular ma-trix  regulators  that  frequently  investigate  cardiovascular  diseases  and  cancer metastasis. Our study aimed to examine specific polymorphisms in the MMP9 gene in our patients with aortic dissection and compare the effect of MMP9 on aortic dissection with expression datasets.

Materials  and  Methods:  Q279R  and  P574R  polymorphisms  were  analyzed  in  44  aortic  dissection  patients  and  40  healthy  donors  via  polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism. (PCR-RFLP)  methods.  Q279R  and  P574R  prevalence  was  statistically  compared  with  the  medical  data  of  the  patients.  Additionally,  we  col-lected datasets of aortic dissection from NCBI GEO to reanalyze GEO2R and RStudio to see metalloproteinase activity on samples. Later, enrich-ment analysis was processed on  widely used databases.

Results: Genotypic distribution of alleles was similar in the two study groups.  In  addition  to  this,  female  CG  carriers  had  a  higher  risk  of  de-veloping  aortic  dissection  than  those  of  males.  As  the  results  of  the  protein-protein interaction analysis of MMP9 and patients’ clinical data, hypertension was found to be the significant outcome of P574R varia-tion in the patients. In array analysis, MMP9 expression did not change critically,  but  TIMPs  had  been  downregulated  in  many  samples.  Also,  MMP9 targeted miRNA expression levels were detected as low in aortic tissue and blood.

Conclusion:  Q279R  and  P574R  are  two  polymorphisms  that  do  not  di-rectly  affect  MMP9  protein  structure.  Consequently,  studied  polymor-phisms  and  performed  meta-analysis  show  that  MMP9  does  not  spark  off the phenotype but sets the stage for aortic dissection development as  seen  in  the  statistical  results.  Furthermore,  enrichment  analysis  on  datasets shows MMP9 was not a primary reason for vascular remodeling.

.

 


Amaç: Kardiyovasküler hastalıklar ve kanser metastazında sıklıkla araştı-rılan  matriks  metalloproteinazlar  (MMPs)  ekstraselüler  matriks  düzenle-yicileridir. Çalışmamız, aort diseksiyonu olan hastalarda MMP9 genindeki spesifik polimorfizmleri incelemeyi ve MMP9'un aort diseksiyonu üzerin-deki etkisini ekspresyon veri setleri ile karşılaştırmayı amaçlamaktadır.

Gereç ve Yöntem: Q279R ve P574R polimorfizmleri 44 aort diseksiyon tanısı almış ve 40 sağlıklı bireyde polimeraz zincir reaksiyonu - restrik-siyon  parça  uzunluğu  polimorfizmi    (PCR-RFLP)  yöntemiyle  çalışıldı.  Q279R ve P574R prevalansı istatistiksel olarak hastaların tıbbi verileriyle karşılaştırıldı. Buna ek olarak, NCBI GEO veri tabanından aort diseksiyon veri setleri toplandı ve MMP9 ifadesindeki farklılıkları görmek amacıyla bu  veri  setleri  GEO2R  ve  RStudio  ile  yeniden  analiz  edildi.  Elde  edilen  sonuçların informatik analizi için çevrimiçi veri tabanları kullanıldı.

Bulgular: CG alleli taşıyıcısı kadınların aort diseksiyonu geliştirme riski erkeklerden daha yüksek bulunmasına rağmen her iki çalışma grubun-da da allellerin genotipik dağılımı benzer bulunmuştur. MMP9'un pro-tein-protein  etkileşim  analizinin  ve  hastaların  tıbbi  verilerinin  incelen-mesinin  sonucu  olarak,  P574R  hipertansiyonu  olan  hastalarda  önemli  bir bulgu olarak değerlendirilmiştir. Array verisi analizinde ise MMP9 ifa-desinde  kritik  bir  değişim  gözlemlenmemiş  olup,  birçok  örnekte  TIMPifade seviyelerinde azalma tespit edilmiştir. Ayrıca MMP9’u hedefleyen miRNA  ekspresyon  seviyelerinin  aort  dokusu  ve  kanda  düşük  olduğu  saptanmıştır.

Sonuç: Q279R ve P574R, MMP9 protein yapısını doğrudan etkilemeyen iki polimorfizmdir. İncelenen polimorfizmler ve gerçekleştirilen meta-a-nalizler, MMP9'un  fenotipi  doğrudan  etkilemediği,  ancak  istatistiksel  sonuçlarda  görüldüğü  gibi  aort  diseksiyonu  gelişimi  için  zemin  hazır-ladığını göstermektedir.

.

Makale detayları

A Brief Reconnoitre about Effects of MMP9 on Aortic Dissection

Yazarlar: Burcu SALMAN YAYLAZ | Melda SARIMAN | Ahmet EKMEKÇİ | Emel ERGÜL | Mahmut ULUGANYAN | Fulya COŞAN | Özgün Melike TOTUK GEDAR | Neslihan ABACI

Yayıncı: Istanbul University

Ana Başlıklar: Hastalıklar

Dergi: Experimed 2021 Vol.11 Issue 1, pp.12-20

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 5/2021

Belge Dili: İngilizce

Document ID (Org No.): 2000428921

eISSN: 2667-5846

DOI: https://doi.org/10.26650/experimed.2021.874159

Sayı

Yazarlar:

Burcu SALMAN YAYLAZ | Melda SARIMAN | Ahmet EKMEKÇİ | Emel ERGÜL | Mahmut ULUGANYAN | Fulya COŞAN | Özgün Melike TOTUK GEDAR | Neslihan ABACI

Yayıncı:

Istanbul University

Ana Başlıklar:

Hastalıklar

Dergi:

Experimed 2021 Vol.11 Issue 1, pp.12-20

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

5/2021

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000428921

eISSN:

2667-5846

DOI:

https://doi.org/10.26650/experimed.2021.874159