Fasulye Tohumlarındaki Viral Etmenlerin Saptanmasında Tanı Yöntemlerinin Duyarlılıklarının İncelenmesi

Kübra SARAÇOĞLU; Semih ERKAN

Makale detayları

Fasulye Tohumlarındaki Viral Etmenlerin Saptanmasında Tanı Yöntemlerinin Duyarlılıklarının İncelenmesi

Yazarlar:

Kübra SARAÇOĞLU | Semih ERKAN

Yayıncı:

Ege University

Ana Başlıklar:

Uygulamalı fizik

Dergi:

Journal of Agriculture Faculty of Ege University 2016 Vol.53 Issue 3, pp.309-315

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

9/2016

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000958184

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

2548-1207

pISSN:

1018-8851

Anahtar kelimeler:

Özet:

 


The
study was conducted to find out the presence of viral infections in 70
bean seed samples providing from different seed companies and Ege University
Faculty of Agriculture Department of Horticulture. In order to determine the
sensitivity of the methods used in the detection of viral infections in bean
seed samples, the studies carried out in 2012 and 2013 years. To detect the
viral infections in bean seed samples; symptomatology, growing-on test,
biological test (mechanical inoculation), serological and molecular methods
were used. The presence of 5 viral agents in bean seed samples was checked by
RT-PCR, while the diagnosis of other 4 viruses was done with DAS-ELISA.
Considering the results obtained, the sensitivity of the methods used in this
work was investigated for the detection of viruses in bean seed samples. Out of
70 bean seed samples, the infection of certain viruses was detected in 69
samples by RT-PCR, 62 by DAS-ELISA, 48 by viral examinations and 30 by
biological indexing. In growing-on assays, the viral infections were found in
48 of 64 plants developing from 70 seed samples. BCMV, BCMNV, CMV,
and SMV were detected in seed samples, while AMV was not found. According to the
findings from this study, it was found that RT-PCR was the most sensitive
methods in the detection of the viruses in bean seed samples and the majority
of bean seed samples was infected with BCMV.

.

 





Bu çalışma,
2012 ve 2013 yıllarında değişik tohum firmalarından ve Ege Üniversitesi Ziraat
Fakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü’nden temin edilen 70 adet farklı fasulye tohum
örneğinde virüslerin bulunma durumunun ve bu virüslerin tanılanmasında
kullanılan yöntemlerin duyarlılıklarının belirlenmesi amacıyla yürütülmüştür.
Fasulye tohum örneklerindeki viral etmenlerin tanılanmasında simptomatoloji,
bitki yetiştirme, biyolojik testleme (mekanik inokulasyon), seroloji ve
moleküler yöntemler kullanılmıştır. Tohum örneklerinde 5 viral etmenin varlığı
RT-PCR, 4 virüsün tanılanması ise DAS-ELISA yöntemi ile incelenmiş ve bu
yöntemlerin diğer yöntemlerle duyarlılık durumu kıyaslanmıştır. Çalışmadaki
toplam 70 tohum örneğinin RT-PCR yöntemi ile 69'u, DAS-ELISA yöntemi ile 62'si,
mekanik inokulasyon ile 30'ı, tohumdaki belirtilerin görsel olarak incelenmesi
ile 48'i ve bitki yetiştirme testleri ile 70 tohum örneğinden gelişme gösteren
64 bitkiden 48'i enfektelidir. Tohum örneklerinde BCMV, BCMNV, CMV ve SMV adlı
viral etmenlerinin olduğu bulunurken, AMV’ne rastlanılmamıştır. Elde edilen
sonuçlara göre, tanılama yöntemleri arasında RT-PCR' ın en duyarlı yöntem
olduğu ve tohum örneklerinin büyük bir kısmının BCMV ile enfekteli bulunduğu
görülmüştür.

.

Makale detayları

Fasulye Tohumlarındaki Viral Etmenlerin Saptanmasında Tanı Yöntemlerinin Duyarlılıklarının İncelenmesi

Yazarlar:

Kübra SARAÇOĞLU | Semih ERKAN

Yayıncı:

Ege University

Ana Başlıklar:

Uygulamalı fizik

Dergi:

Journal of Agriculture Faculty of Ege University 2016 Vol.53 Issue 3, pp.309-315

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

9/2016

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000958184

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

2548-1207

pISSN:

1018-8851

Fasulye

tohum

viral enfeksiyonlar

tanılama yöntemleri

Sayı

Makale detayları

Fasulye Tohumlarındaki Viral Etmenlerin Saptanmasında Tanı Yöntemlerinin Duyarlılıklarının İncelenmesi

Yazarlar: Kübra SARAÇOĞLU | Semih ERKAN

Yayıncı: Ege University

Ana Başlıklar: Uygulamalı fizik

Dergi: Journal of Agriculture Faculty of Ege University 2016 Vol.53 Issue 3, pp.309-315

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 9/2016

Belge Dili: Türkçe

Document ID (Org No.): 2000958184

Sıklık: Üç Aylık

eISSN: 2548-1207

pISSN: 1018-8851

Fasulye

tohum

viral enfeksiyonlar

tanılama yöntemleri

Sayı

Yazarlar:

Kübra SARAÇOĞLU | Semih ERKAN

Yayıncı:

Ege University

Ana Başlıklar:

Uygulamalı fizik

Dergi:

Journal of Agriculture Faculty of Ege University 2016 Vol.53 Issue 3, pp.309-315

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

9/2016

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000958184

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

2548-1207

pISSN:

1018-8851