Ordu ilinde bulunan Rubus (Rosaceae) türlerinin trnL-F gen bölgeleri ile filogenetik ilişkilerinin belirlenmesi

Seçil EKER; Onur KOLÖREN

Makale detayları

Ordu ilinde bulunan Rubus (Rosaceae) türlerinin trnL-F gen bölgeleri ile filogenetik ilişkilerinin belirlenmesi

Yazarlar:

Seçil EKER | Onur KOLÖREN

Yayıncı:

Ordu University

Ana Başlıklar:

Tarım

Dergi:

Akademik Ziraat Dergisi 2020 Vol.9 Issue 2, pp.223-228

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

12/2020

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000878638

Sıklık:

Aylık

eISSN:

2618-5881

pISSN:

2147-6403

Anahtar kelimeler:

Özet:

 


Bu çalışmada; Karadeniz Bölgesi Ordu ilinde yaygın olan Rubus yabancı ot türlerinin filogenetik
farklılıkları trnL-F gen bölgeleri
kullanılarak belirlenmeye çalışılmıştır. Ordu’nun farklı noktalarından 24 adet Rubus spp. örneği survey yapılmıştır. Örneklerden
DNA izole etme aşamasında protokol Haymes (1996) uyarlanarak kullanılmıştır. Örneklerimizin
trnL-F gen bölgesini belirlemek için,
GenBank’tan alınan referans diziler ile çalışmamızda elde ettiğimiz sekans
dizileri karşılaştırılmıştr. MEGA6 paket programı yardımıyla genetik uzaklıklar
hesaplanmış ve filogeni ağaçlarının çizimi yapılmıştır. Örneklerden 6 Haplotip
sonucu çıkmıştır. Bunlar; Haplotip 1 (F3, P1, P3, P4, U1, U2, O2, O3, O4, CM1),
Haplotip 2 (F5), Haplotip 3 (P2), Haplotip 4 (P5), Haplotip 5 (S1, CM2, CM3),
Haplotip 6 (O1, CT1, CT2, CT3) örnekleri sırasıyla R. sanctus (EF055343), R.
silvaticus (KM036881), R. divaricatus
(KM036924), R. conothyrsoides (KM036856),
R. capricollensis (KM036923) ve Rubus sp. (KT581217)  ile %100 nükleotid dizisi benzerliğiyle akraba
olarak görülmüştür. 


.

Makale detayları

Ordu ilinde bulunan Rubus (Rosaceae) türlerinin trnL-F gen bölgeleri ile filogenetik ilişkilerinin belirlenmesi

Yazarlar:

Seçil EKER | Onur KOLÖREN

Yayıncı:

Ordu University

Ana Başlıklar:

Tarım

Dergi:

Akademik Ziraat Dergisi 2020 Vol.9 Issue 2, pp.223-228

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

12/2020

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000878638

Sıklık:

Aylık

eISSN:

2618-5881

pISSN:

2147-6403

DNA

gen bölgesi

haplotip

Karadeniz Bölgesi

Rubus spp.

Sayı

Makale detayları

Ordu ilinde bulunan Rubus (Rosaceae) türlerinin trnL-F gen bölgeleri ile filogenetik ilişkilerinin belirlenmesi

Yazarlar: Seçil EKER | Onur KOLÖREN

Yayıncı: Ordu University

Ana Başlıklar: Tarım

Dergi: Akademik Ziraat Dergisi 2020 Vol.9 Issue 2, pp.223-228

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 12/2020

Belge Dili: Türkçe

Document ID (Org No.): 2000878638

Sıklık: Aylık

eISSN: 2618-5881

pISSN: 2147-6403

DNA

gen bölgesi

haplotip

Karadeniz Bölgesi

Rubus spp.

Sayı

Yazarlar:

Seçil EKER | Onur KOLÖREN

Yayıncı:

Ordu University

Ana Başlıklar:

Tarım

Dergi:

Akademik Ziraat Dergisi 2020 Vol.9 Issue 2, pp.223-228

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

12/2020

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000878638

Sıklık:

Aylık

eISSN:

2618-5881

pISSN:

2147-6403