Benchmark Study of Computational Methods for Predicting Partition Coefficient of Chlormethiazole

Sümeyya SERİN; Ali BAYRİ

doi:https://doi.org/10.31202/ecjse.978741

Makale detayları

Benchmark Study of Computational Methods for Predicting Partition Coefficient of Chlormethiazole

Yazarlar:

Sümeyya SERİN | Ali BAYRİ

Yayıncı:

Tayfun UYGUNOĞLU

Ana Başlıklar:

Uygulamalı fizik

Dergi:

El-Cezeri 2022 Vol.9 Issue 2, pp.567-575

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

5/2022

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000404441

eISSN:

2148-3736

pISSN:

2148-3736

DOI:

https://doi.org/10.31202/ecjse.978741

Özet:

 

The present study contains the evaluations of lipophilicity estimation, HOMO-LUMO analysis, and electrostatic surface properties of Chlormethiazole molecule by using quantum chemical calculation techniques. All geometrical optimizations, energy and frequency calculations were carried out with six different basis sets by choosing the Hartree-Fock (HF) method and two different Density Functional Theory (DFT) functionals B3LYP and B3PW91. All calculations were repeated for the water and n-octanol phases by using SMD solvation model in order to investigate the solvent effect and also to obtain the Gibbs free energies of solvation that help to estimate partition coefficients. As a result, among the applied theoretical methods, the best agreement with the experimental logP value was obtained with the HF/6-31G(d,p) method. Also, it is concluded that the forecast performance of the computational methods decreases in the following order: HF> B3LYP> B3PW91.

 

Bu çalışma, kuantum kimyasal hesaplama teknikleri kullanılarak Klormetiazol molekülünün lipofiliklik tahmini, HOMO-LUMO analizi ve elektrostatik yüzey özelliklerinin değerlendirmelerini içermektedir. Tüm geometrik optimizasyonlar, enerji ve frekans hesaplamaları, Hartree-Fock (HF) yöntemi ve iki farklı Yoğunluk Fonksiyonel Teori (YFT) fonksiyoneli B3LYP ve B3PW91 seçilerek altı farklı temel set ile gerçekleştirilmiştir. Çözücü etkisini araştırmak ve ayrıca bölme katsayılarını tahmin etmeye yardımcı olan Gibbs solvasyon serbest enerjilerini elde etmek için tüm hesaplamalar su ve n-oktanol fazları için SMD solvasyon modeli kullanılarak tekrarlanmıştır. Sonuç olarak, uygulanan teorik yöntemler arasında deneysel logP değeri ile en iyi uyum HF/6-31G(d,p) yöntemi ile elde edilmiştir. Ayrıca hesaplamalı yöntemlerin tahmin performansının HF> B3LYP> B3PW91 sırasıyla azaldığı sonucuna varılmıştır.

Makale detayları

Benchmark Study of Computational Methods for Predicting Partition Coefficient of Chlormethiazole

Yazarlar: Sümeyya SERİN | Ali BAYRİ

Yayıncı: Tayfun UYGUNOĞLU

Ana Başlıklar: Uygulamalı fizik

Dergi: El-Cezeri 2022 Vol.9 Issue 2, pp.567-575

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 5/2022

Belge Dili: İngilizce

Document ID (Org No.): 2000404441

eISSN: 2148-3736

pISSN: 2148-3736

DOI: https://doi.org/10.31202/ecjse.978741

Sayı

Yazarlar:

Sümeyya SERİN | Ali BAYRİ

Yayıncı:

Tayfun UYGUNOĞLU

Ana Başlıklar:

Uygulamalı fizik

Dergi:

El-Cezeri 2022 Vol.9 Issue 2, pp.567-575

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

5/2022

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000404441

eISSN:

2148-3736

pISSN:

2148-3736

DOI:

https://doi.org/10.31202/ecjse.978741