Gerze Tavuğu ve Bazı Saf Hat Genotiplerinde Majör Doku Uyumluluğu Gen Kompleksi Polimorfizmi

Derya EKİNCİ; Levent MERCAN

Makale detayları

Gerze Tavuğu ve Bazı Saf Hat Genotiplerinde Majör Doku Uyumluluğu Gen Kompleksi Polimorfizmi

Yazarlar:

Derya EKİNCİ | Levent MERCAN

Ana Başlıklar:

Üretim

Dergi:

Journal Of Agriculture and Nature 2020 Vol.23 Issue 3, pp.781-787

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

6/2020

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000503031

Özet:

 


The aim of this study was
to molecularly investigate the major histocompatibility complex (MHC)
polymorphisms of the Gerze chicken population of 43 samples and the commercial
pure line population of 50 samples. Allelic diversity was calculated based on PCR
amplification of MCW0371 and LEI0258 microsatellite loci in MHC and separation
of DNA fragments by agarose gel electrophoresis. In the Gerze population,
number of different alleles, number of effective alleles, observed
heterozygosity and expected heterozygosity values were calculated as: 16,
10.82, 0.67, 0.91, whereas the values were determined as 19, 11.84, 0.60, 0.92
for the pure line population, respectively for LEI0258 locus. As for MCW0371
locus, the values were calculated as 3, 2.68, 0, 0.63 in the Gerze population
and 3, 1.96, 0, 0.49 in the Pure line population, respectively. Nei’s genetic
distance and genetic identity values between the populations were calculated as
0.419 and 0.658, respectively. The FST value among the populations
was found to be 0.068. The findings revealed that Gerze chicken should be
included in breeding programs as a unique genetic resource with its allelic
richness.

.

 


Bu çalışmada Gerze tavuğu
popülasyonuna ait 43 örnek ile ticari saf hatlardan oluşturulan 50 örneklik Saf
hat popülasyonunun majör doku uyumluluğu gen kompleksi (MHC) bakımından
moleküler incelenmesi amaçlanmıştır. Allelik çeşitlilik, MHC içerisinde yer
alan MCW0371 ve LEI0258 mikrosatellit lokuslarının PCR yöntemi yardımıyla
çoğaltılarak elde edilen DNA fragmentlerinin agaroz jel elektroforezi ile
ayrımlanması ile hesaplanmıştır. Gerze popülasyonunda LEI0258 lokusunda elde
edilen allel sayısı, etkili allel sayısı, gözlenen heterozigotluk ve beklenen
heterozigotluk değerleri sırasıyla; 16, 10.82, 0.67, 0.91, Saf hat
popülasyonunda ise 19, 11.84, 0.60, 0.92 olarak bulunmuştur. MCW0371 lokusu
için sırasıyla; Gerze popülasyonunda 3, 2.68, 0, 0.63 ve Saf hat popülasyonunda
3, 1.96, 0, 0.49 olarak tespit edilmiştir. Popülasyonlar arasında Nei genetik
uzaklık ve genetik benzerlik değerleri sırasıyla 0.419 ve 0.658 olarak
hesaplanmıştır. Popülasyonlar arasında FST değeri 0.068 olarak
bulunmuştur. Elde edilen bulgular,
içerdiği allel deseni bakımından Gerze tavuğunun özgün bir genetik kaynak
olarak korunmasının ve ıslah programlarına dahil edilmesinin önemli olduğu
sonucuna varılmıştır.

.

Makale detayları

Gerze Tavuğu ve Bazı Saf Hat Genotiplerinde Majör Doku Uyumluluğu Gen Kompleksi Polimorfizmi

Yazarlar: Derya EKİNCİ | Levent MERCAN

Ana Başlıklar: Üretim

Dergi: Journal Of Agriculture and Nature 2020 Vol.23 Issue 3, pp.781-787

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 6/2020

Belge Dili: Türkçe

Document ID (Org No.): 2000503031

Sayı

Yazarlar:

Derya EKİNCİ | Levent MERCAN

Ana Başlıklar:

Üretim

Dergi:

Journal Of Agriculture and Nature 2020 Vol.23 Issue 3, pp.781-787

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

6/2020

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2000503031