Use of RAPD-PCR for genetic analyses on the native cattle breeds in  Turkey

Güven GÜNEREN; Bilal AKYÜZ; Okan ERTUGRUL

doi:https://doi.org/10.1501/Vetfak_0000002370

Makale detayları

Use of RAPD-PCR for genetic analyses on the native cattle breeds in Turkey

Yazarlar:

Güven GÜNEREN | Bilal AKYÜZ | Okan ERTUGRUL

Ana Başlıklar:

Hayvancılık

Dergi:

Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2010 Vol.57 Issue 3, pp.167-172

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

8/2010

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000850842

DOI:

https://doi.org/10.1501/Vetfak_0000002370

Anahtar kelimeler:

Özet:

 

The purpose of this study was to identify the genetic relationship and variations within and between local cattle breeds of Turkey using RAPD-PCR method which needs fewer substructures when compared to other DNA fingerprinting methods. The RAPD-PCR method was performed on blood samples of 77 animals from four breeds namely Anatolian Black (AB), East Anatolian Red (EAR), South Anatolian Red (SAR) and Turkish Grey Steppe (TG). A set of ten arbitrary 10-mer primers were used to detect the DNA polymorphisms in the whole genome. Estimation of the genetic distances between the breeds was conducted through the FST Distant Estimation Method, and cluster trees were constructed by UPGMA Method. Based on the band sharing method, the average genetic variances of the breeds varied from 0.637 (in TG) to 0.809 (in SAR), AB and EAR had 0.792 and 0.787, respectively. It was concluded that AB breed is more closely related to EAR breed than to SAR breed while TG breed was determined as a distinct group from other breeds.

 

Bu çalışmada, diğer DNA parmak izi yöntemleri ile karşılaştırıldığında daha az alt yapıya ihtiyaç duyan RAPD-PCR metodu kullanılarak Türkiye yerli sığır ırklarında ırk içi ve ırklar arası genetik ilişki ve genetik varyasyonların belirlenmesi amaçlanmıştır. RAPD-PCR metodu Yerli Kara (YK), Doğu Anadolu Kırmızısı (DAK), Güney Anadolu Kırmızısı (GAK) ve Boz Irk’tan (BI) toplam 77 hayvandan alınan kan örnekleri kullanılarak yapılmıştır. DNA’larda polimorfizmleri belirlemek için 10 bazdan oluşan 10 primer seti kullanılmıştır. Irklar arası mesafe FST Mesafe Tahmin Metoduyla, ırklara ait gruplama ağaçları UPGMA metoduyla yapılmıştır. Bantların varlığına göre ırkların ortalama genetik varyansları 0,637 (BI)’den 0,809 (GAK)’a kadar değiştiği görülmüştür. YK ırkının DAK ırkına GAK ırkından daha yakın olduğu, BI ise her üç ırktan farklı bir kümede bulunduğu belirlenmiştir.

Makale detayları

Use of RAPD-PCR for genetic analyses on the native cattle breeds in Turkey

Yazarlar:

Güven GÜNEREN | Bilal AKYÜZ | Okan ERTUGRUL

Ana Başlıklar:

Hayvancılık

Dergi:

Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2010 Vol.57 Issue 3, pp.167-172

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

8/2010

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000850842

DOI:

https://doi.org/10.1501/Vetfak_0000002370

DNA parmak izi

filogenetik

ırk karakterizasyonu

Türkiye yerli sığır ırkları

RAPD-PCR

Sayı

Makale detayları

Use of RAPD-PCR for genetic analyses on the native cattle breeds in Turkey

Yazarlar: Güven GÜNEREN | Bilal AKYÜZ | Okan ERTUGRUL

Ana Başlıklar: Hayvancılık

Dergi: Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2010 Vol.57 Issue 3, pp.167-172

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 8/2010

Belge Dili: İngilizce

Document ID (Org No.): 2000850842

DOI: https://doi.org/10.1501/Vetfak_0000002370

DNA parmak izi

filogenetik

ırk karakterizasyonu

Türkiye yerli sığır ırkları

RAPD-PCR

Sayı

Yazarlar:

Güven GÜNEREN | Bilal AKYÜZ | Okan ERTUGRUL

Ana Başlıklar:

Hayvancılık

Dergi:

Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2010 Vol.57 Issue 3, pp.167-172

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

8/2010

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000850842

DOI:

https://doi.org/10.1501/Vetfak_0000002370