2017-2022 Yılları Arasında Viral Gastroenterit Etkenlerinin Değerlendirilmesi: Bir Cerrahpaşa Deneyimi

Aylin Dağ Güzel; Yesim Tok; Okan Kadir Nohut; Seda Salman Yılmaz; Özge Altınok; Mert Kuskucu; Kenan Midilli

Makale detayları

2017-2022 Yılları Arasında Viral Gastroenterit Etkenlerinin Değerlendirilmesi: Bir Cerrahpaşa Deneyimi

Yazarlar:

Aylin Dağ Güzel | Yesim Tok | Okan Kadir Nohut | Seda Salman Yılmaz | Özge Altınok | Mert Kuskucu | Kenan Midilli

Yayıncı:

Istanbul Aydin University

Ana Başlıklar:

Klinik Tıp Bilimleri

Dergi:

Tıp Fakültesi Klinikleri Dergisi Vol.6 Issue 2, pp.139-152

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

7/2023

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2001296601

pISSN:

2630-5585

Anahtar kelimeler:

Özet:

 Amaç: Bu çalışmanın amacı, laboratuvarımızda son 5 yılda gastroenterit ön tanısı almış hastalardan alınan örneklerde viral etken profilini değerlendirmektir. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada, Nisan 2017-Ekim 2022 tarihleri arasında İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen akut gastroenterite AGE neden olabilecek viral patojenlerin saptanması için gelen 354 gaita örneği incelenmiştir. Çalışmada multipleks sendromik gastrointestinal panelde taranmak üzere 5 farklı viral AGE ajan İnsan Adenovirüsü F40F41, Norovirüs GI, Norovirüs GII, Rotavirüs A, Astrovirüs ve Sapovirüsler saptanan örneklerin dağılım yüzdelerine bakılmıştır. Laboratuvarımızda multipleks sendromik gastrointestinal panelde QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel, Real-Time PCR, Qiagen, Almanya çalışılan bu dışkı örneklerinden elde edilen sonuçlar retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Bulgular: 2017-2022 arasında AGE şüphesiyle gelen 354 gaita örneğinin 105 tanesi viral etken yönünden pozitif bulunmuşken, 249 tanesinde ise viral patojen saptanmamıştır. Pozitif bulunan 105 örnekte; 4 tane Astrovirus, 17 tane Adeonovirus, 69 tane Norovirus, 1 tane Sapovirus ve 14 tane de Rotavirus saptanmıştır. Sonuç: Enterik virüslerin saptanmasında nükleik asit amplifikasyon testleri NAAT nin kullanılması, bu virüslerin akut gasrtoenteritlerdeki rolünün ve kapsamının aydınlatılmasında büyük bir ilerleme olmuştur. AGE tablolarında olası viral etkenlerin hızlı ve güvenilir bir tanı yöntemi ile saptanması, özellikle bağışıklığı baskılanmış hasta gruplarında gereksiz antimikrobiyal ilaç kullanımı da önlenmiş olacaktır. Potansiyel AGE ajanlarının hızlı ve doğru tayini; tedavi, hastaneye yatış, enfeksiyon kontrolü ve hastanın sağlığına kavuşması açısından uygun kararlar verilmesine ve kontrol önlemlerinin daha hedefe uygun olarak uygulanmasına yardım edecektir. Bu sebeple AGE etkenlerinin özellikle de risk gruplarında hızlı tanısı için moleküler testlerin yaygınlaşması ve analizlerin birçok etkene aynı anda bakılmasına olanak sağlayacak test sistlemlerinin yaygınlaşması ile hem hızlı ve doğru sonuç açısından hem de tüm gastroenterit etken profillerine ait sağlıklı verilerin toplanmasına destek olacağını düşünmekteyiz.

 Amaç: Bu çalışmanın amacı, laboratuvarımızda son 5 yılda gastroenterit ön tanısı almış hastalardan alınan örneklerde viral etken profilini değerlendirmektir. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada, Nisan 2017-Ekim 2022 tarihleri arasında İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen akut gastroenterite AGE neden olabilecek viral patojenlerin saptanması için gelen 354 gaita örneği incelenmiştir. Çalışmada multipleks sendromik gastrointestinal panelde taranmak üzere 5 farklı viral AGE ajan İnsan Adenovirüsü F40F41, Norovirüs GI, Norovirüs GII, Rotavirüs A, Astrovirüs ve Sapovirüsler saptanan örneklerin dağılım yüzdelerine bakılmıştır. Laboratuvarımızda multipleks sendromik gastrointestinal panelde QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel, Real-Time PCR, Qiagen, Almanya çalışılan bu dışkı örneklerinden elde edilen sonuçlar retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Bulgular: 2017-2022 arasında AGE şüphesiyle gelen 354 gaita örneğinin 105 tanesi viral etken yönünden pozitif bulunmuşken, 249 tanesinde ise viral patojen saptanmamıştır. Pozitif bulunan 105 örnekte; 4 tane Astrovirus, 17 tane Adeonovirus, 69 tane Norovirus, 1 tane Sapovirus ve 14 tane de Rotavirus saptanmıştır. Sonuç: Enterik virüslerin saptanmasında nükleik asit amplifikasyon testleri NAAT nin kullanılması, bu virüslerin akut gasrtoenteritlerdeki rolünün ve kapsamının aydınlatılmasında büyük bir ilerleme olmuştur. AGE tablolarında olası viral etkenlerin hızlı ve güvenilir bir tanı yöntemi ile saptanması, özellikle bağışıklığı baskılanmış hasta gruplarında gereksiz antimikrobiyal ilaç kullanımı da önlenmiş olacaktır. Potansiyel AGE ajanlarının hızlı ve doğru tayini; tedavi, hastaneye yatış, enfeksiyon kontrolü ve hastanın sağlığına kavuşması açısından uygun kararlar verilmesine ve kontrol önlemlerinin daha hedefe uygun olarak uygulanmasına yardım edecektir. Bu sebeple AGE etkenlerinin özellikle de risk gruplarında hızlı tanısı için moleküler testlerin yaygınlaşması ve analizlerin birçok etkene aynı anda bakılmasına olanak sağlayacak test sistlemlerinin yaygınlaşması ile hem hızlı ve doğru sonuç açısından hem de tüm gastroenterit etken profillerine ait sağlıklı verilerin toplanmasına destek olacağını düşünmekteyiz.

 Amaç: Bu çalışmanın amacı, laboratuvarımızda son 5 yılda gastroenterit ön tanısı almış hastalardan alınan örneklerde viral etken profilini değerlendirmektir. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada, Nisan 2017-Ekim 2022 tarihleri arasında İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen akut gastroenterite AGE neden olabilecek viral patojenlerin saptanması için gelen 354 gaita örneği incelenmiştir. Çalışmada multipleks sendromik gastrointestinal panelde taranmak üzere 5 farklı viral AGE ajan İnsan Adenovirüsü F40F41, Norovirüs GI, Norovirüs GII, Rotavirüs A, Astrovirüs ve Sapovirüsler saptanan örneklerin dağılım yüzdelerine bakılmıştır. Laboratuvarımızda multipleks sendromik gastrointestinal panelde QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel, Real-Time PCR, Qiagen, Almanya çalışılan bu dışkı örneklerinden elde edilen sonuçlar retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Bulgular: 2017-2022 arasında AGE şüphesiyle gelen 354 gaita örneğinin 105 tanesi viral etken yönünden pozitif bulunmuşken, 249 tanesinde ise viral patojen saptanmamıştır. Pozitif bulunan 105 örnekte; 4 tane Astrovirus, 17 tane Adeonovirus, 69 tane Norovirus, 1 tane Sapovirus ve 14 tane de Rotavirus saptanmıştır. Sonuç: Enterik virüslerin saptanmasında nükleik asit amplifikasyon testleri NAAT nin kullanılması, bu virüslerin akut gasrtoenteritlerdeki rolünün ve kapsamının aydınlatılmasında büyük bir ilerleme olmuştur. AGE tablolarında olası viral etkenlerin hızlı ve güvenilir bir tanı yöntemi ile saptanması, özellikle bağışıklığı baskılanmış hasta gruplarında gereksiz antimikrobiyal ilaç kullanımı da önlenmiş olacaktır. Potansiyel AGE ajanlarının hızlı ve doğru tayini; tedavi, hastaneye yatış, enfeksiyon kontrolü ve hastanın sağlığına kavuşması açısından uygun kararlar verilmesine ve kontrol önlemlerinin daha hedefe uygun olarak uygulanmasına yardım edecektir. Bu sebeple AGE etkenlerinin özellikle de risk gruplarında hızlı tanısı için moleküler testlerin yaygınlaşması ve analizlerin birçok etkene aynı anda bakılmasına olanak sağlayacak test sistlemlerinin yaygınlaşması ile hem hızlı ve doğru sonuç açısından hem de tüm gastroenterit etken profillerine ait sağlıklı verilerin toplanmasına destek olacağını düşünmekteyiz.

 Amaç: Bu çalışmanın amacı, laboratuvarımızda son 5 yılda gastroenterit ön tanısı almış hastalardan alınan örneklerde viral etken profilini değerlendirmektir. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada, Nisan 2017-Ekim 2022 tarihleri arasında İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen akut gastroenterite AGE neden olabilecek viral patojenlerin saptanması için gelen 354 gaita örneği incelenmiştir. Çalışmada multipleks sendromik gastrointestinal panelde taranmak üzere 5 farklı viral AGE ajan İnsan Adenovirüsü F40F41, Norovirüs GI, Norovirüs GII, Rotavirüs A, Astrovirüs ve Sapovirüsler saptanan örneklerin dağılım yüzdelerine bakılmıştır. Laboratuvarımızda multipleks sendromik gastrointestinal panelde QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel, Real-Time PCR, Qiagen, Almanya çalışılan bu dışkı örneklerinden elde edilen sonuçlar retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Bulgular: 2017-2022 arasında AGE şüphesiyle gelen 354 gaita örneğinin 105 tanesi viral etken yönünden pozitif bulunmuşken, 249 tanesinde ise viral patojen saptanmamıştır. Pozitif bulunan 105 örnekte; 4 tane Astrovirus, 17 tane Adeonovirus, 69 tane Norovirus, 1 tane Sapovirus ve 14 tane de Rotavirus saptanmıştır. Sonuç: Enterik virüslerin saptanmasında nükleik asit amplifikasyon testleri NAAT nin kullanılması, bu virüslerin akut gasrtoenteritlerdeki rolünün ve kapsamının aydınlatılmasında büyük bir ilerleme olmuştur. AGE tablolarında olası viral etkenlerin hızlı ve güvenilir bir tanı yöntemi ile saptanması, özellikle bağışıklığı baskılanmış hasta gruplarında gereksiz antimikrobiyal ilaç kullanımı da önlenmiş olacaktır. Potansiyel AGE ajanlarının hızlı ve doğru tayini; tedavi, hastaneye yatış, enfeksiyon kontrolü ve hastanın sağlığına kavuşması açısından uygun kararlar verilmesine ve kontrol önlemlerinin daha hedefe uygun olarak uygulanmasına yardım edecektir. Bu sebeple AGE etkenlerinin özellikle de risk gruplarında hızlı tanısı için moleküler testlerin yaygınlaşması ve analizlerin birçok etkene aynı anda bakılmasına olanak sağlayacak test sistlemlerinin yaygınlaşması ile hem hızlı ve doğru sonuç açısından hem de tüm gastroenterit etken profillerine ait sağlıklı verilerin toplanmasına destek olacağını düşünmekteyiz.

Makale detayları

2017-2022 Yılları Arasında Viral Gastroenterit Etkenlerinin Değerlendirilmesi: Bir Cerrahpaşa Deneyimi

Yazarlar: Aylin Dağ Güzel | Yesim Tok | Okan Kadir Nohut | Seda Salman Yılmaz | Özge Altınok | Mert Kuskucu | Kenan Midilli

Yayıncı: Istanbul Aydin University

Ana Başlıklar: Klinik Tıp Bilimleri

Dergi: Tıp Fakültesi Klinikleri Dergisi Vol.6 Issue 2, pp.139-152

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 7/2023

Belge Dili: Türkçe

Document ID (Org No.): 2001296601

pISSN: 2630-5585

Rotavirüs

Adenovirüs

Norovirüs

Viral Gastroenterit

Astrovirüs

Sapovirüs

Sayı

Yazarlar:

Aylin Dağ Güzel | Yesim Tok | Okan Kadir Nohut | Seda Salman Yılmaz | Özge Altınok | Mert Kuskucu | Kenan Midilli

Yayıncı:

Istanbul Aydin University

Ana Başlıklar:

Klinik Tıp Bilimleri

Dergi:

Tıp Fakültesi Klinikleri Dergisi Vol.6 Issue 2, pp.139-152

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

7/2023

Belge Dili:

Türkçe

Document ID (Org No.):

2001296601

pISSN:

2630-5585