Metagenomic characterization of planktonic communities during a mucilage event in the Çanakkale Strait (Dardanelles), Turkey

Sevdan YILMAZ; Mehmet Ali KÜÇÜKER; Dilek KAHRAMAN

doi:https://doi.org/10.35229/jaes.966509

Makale detayları

Metagenomic characterization of planktonic communities during a mucilage event in the Çanakkale Strait (Dardanelles), Turkey

Yazarlar:

Sevdan YILMAZ | Mehmet Ali KÜÇÜKER | Dilek KAHRAMAN

Yayıncı:

Bülent VEREP

Dergi:

Journal of Anatolian Environmental and Animal Sciences 2021 Vol.6 Issue 3, pp.421-427

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

9/2021

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000490123

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

2548-0006

DOI:

https://doi.org/10.35229/jaes.966509

Özet:

 

Bu çalışma da Çanakkale Boğazı'ında (Dardanel) müsilaj oluşumu sırasında planktonik toplulukların kompozisyonları metagenomik yaklaşımla araştırılmıştır. Müsilaj örnekleri, Çanakkale Boğazı'nın üç farklı istasyonunda (İstasyon 1: 40°15'22.53"K, 26°40'43.58"D; İstasyon 2: 40°10'59.21"K 26°37'81.17"D; İstasyon 3: 40°11'15.67"K, 26°39'90.81"D) yoğun müsilaj oluşumu gözlemlenen Mayıs 2021'de toplanmıştır. Filum düzeyinde toplam sekans sayısının 86.68% ini kapsayan baskın planktonik ökaryotlar, Dinoflagellata (%38.57), Protalveolata (%15.03), Diatomea (%12.41), Nematozoa (%8.44), Apicomplexa (%6.79) ve Chlorophyta (%5.43) olarak belirlenmiştir. En baskın OTU'ler (>%10), Alexandrium ve Syndiniales_Group_II olup, diğer baskın OTU'lar (>%2) ise Viscosia sp., Lankesteria, Arcocellulus, Thalassiosira ve Nannochloris olmuştur.
Bu çalışma, Türkiye'de meydana gelen bir müsilaj olayı sırasında Çanakkale Boğazı'nda planktonik toplulukların durumunu netleştirmiştir. Sonuç olarak, en baskın cinsin müsilaj üretme kabiliyeti olduğu bilinen Alexandrium olduğu belirlenmiştir. Bazı Alexandrium türleri toksin üretebilir, insan sağlığı üzerinde ciddi etkilere neden olabilir ve çift kabuklu, karides ve balık ölümlerine yol açabilir. Bu nedenle müsilaj yapısındaki Alexandrium toksinlerinin belirlenmesi için daha detaylı bir çalışmaya ihtiyaç vardır. Ayrıca elde edilen müsilajın ağır metal içeriği araştırılmıştır. Müsilajın yapısındaki As ve Cr konsantrasyonları atıklar için belirlenen düzenli depolama sahalarına bertaraf etme sınırlarının üzerindedir. Bu nedenle deniz yüzeyinden toplanan müsilajın düzenli depolama sahalarına gönderilmeden önce ağır metal içeriği kontrol edilmelidir.

 

Bu çalışma da Çanakkale Boğazı'ında (Dardanel) müsilaj oluşumu sırasında planktonik toplulukların kompozisyonları metagenomik yaklaşımla araştırılmıştır. Müsilaj örnekleri, Çanakkale Boğazı'nın üç farklı istasyonunda (İstasyon 1: 40°15'22.53"K, 26°40'43.58"D; İstasyon 2: 40°10'59.21"K 26°37'81.17"D; İstasyon 3: 40°11'15.67"K, 26°39'90.81"D) yoğun müsilaj oluşumu gözlemlenen Mayıs 2021'de toplanmıştır. Filum düzeyinde toplam sekans sayısının 86.68% ini kapsayan baskın planktonik ökaryotlar, Dinoflagellata (%38.57), Protalveolata (%15.03), Diatomea (%12.41), Nematozoa (%8.44), Apicomplexa (%6.79) ve Chlorophyta (%5.43) olarak belirlenmiştir. En baskın OTU'ler (>%10), Alexandrium ve Syndiniales_Group_II olup, diğer baskın OTU'lar (>%2) ise Viscosia sp., Lankesteria, Arcocellulus, Thalassiosira ve Nannochloris olmuştur.
Bu çalışma, Türkiye'de meydana gelen bir müsilaj olayı sırasında Çanakkale Boğazı'nda planktonik toplulukların durumunu netleştirmiştir. Sonuç olarak, en baskın cinsin müsilaj üretme kabiliyeti olduğu bilinen Alexandrium olduğu belirlenmiştir. Bazı Alexandrium türleri toksin üretebilir, insan sağlığı üzerinde ciddi etkilere neden olabilir ve çift kabuklu, karides ve balık ölümlerine yol açabilir. Bu nedenle müsilaj yapısındaki Alexandrium toksinlerinin belirlenmesi için daha detaylı bir çalışmaya ihtiyaç vardır. Ayrıca elde edilen müsilajın ağır metal içeriği araştırılmıştır. Müsilajın yapısındaki As ve Cr konsantrasyonları atıklar için belirlenen düzenli depolama sahalarına bertaraf etme sınırlarının üzerindedir. Bu nedenle deniz yüzeyinden toplanan müsilajın düzenli depolama sahalarına gönderilmeden önce ağır metal içeriği kontrol edilmelidir.

Makale detayları

Metagenomic characterization of planktonic communities during a mucilage event in the Çanakkale Strait (Dardanelles), Turkey

Yazarlar: Sevdan YILMAZ | Mehmet Ali KÜÇÜKER | Dilek KAHRAMAN

Yayıncı: Bülent VEREP

Dergi: Journal of Anatolian Environmental and Animal Sciences 2021 Vol.6 Issue 3, pp.421-427

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 9/2021

Belge Dili: İngilizce

Document ID (Org No.): 2000490123

Sıklık: Üç Aylık

eISSN: 2548-0006

DOI: https://doi.org/10.35229/jaes.966509

Sayı

Yazarlar:

Sevdan YILMAZ | Mehmet Ali KÜÇÜKER | Dilek KAHRAMAN

Yayıncı:

Bülent VEREP

Dergi:

Journal of Anatolian Environmental and Animal Sciences 2021 Vol.6 Issue 3, pp.421-427

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

9/2021

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000490123

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

2548-0006

DOI:

https://doi.org/10.35229/jaes.966509