DNA from Leaf or Stem: A Comparative Work on Dianthus L. for DNA Barcoding Analysis with Four Commercial Extraction Kits

Zübeyde UĞURLU AYDIN; Mustafa K. ŞENOVA; Marcus KOCH; Ali DÖNMEZ

doi:https://doi.org/10.15671/hjbc.663505

Makale detayları

DNA from Leaf or Stem: A Comparative Work on Dianthus L. for DNA Barcoding Analysis with Four Commercial Extraction Kits

Yazarlar:

Zübeyde UĞURLU AYDIN | Mustafa K. ŞENOVA | Marcus KOCH | Ali DÖNMEZ

Yayıncı:

Hacettepe University

Ana Başlıklar:

Uygulamalı fizik

Dergi:

Hacettepe Journal of Biology and Chemistry 2020 Vol.48 Issue 4, pp.333-339

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

7/2020

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000448221

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

2687-475X

pISSN:

2687-475X

DOI:

https://doi.org/10.15671/hjbc.663505

Özet:

 

GeneAll GenExTM Plant kiti, GeneMATRIX Plant & Fungi DNA Purification kiti, DNeasy Plant kiti ve E.Z.N.A. Plant DNA kiti yaprak ve gövde dokusu DNA barkodlama çalışmaları için kaliteli ve yüksek genomik DNA elde etmek amacıyla test edilmiştir. Geleneksel olarak yaprak dokusu genomik DNA kaynağı olarak kullanılmaktadır fakat Dianthus taksonları yaprak sklerankima dokusu nedeniyle bu bakımdan sorunludur. Genomik DNA, üretici firmanın sağladığı protokole göre elde edilmiştir ve yedi barkod bölgesi PCR yöntemiyle çoğaltılmıştır. DNA konsantrasyonu florometrik yöntemle ölçülmüş, PCR ürünleri agaroz jelde görüntülenmiştir. Sonuçlar, DNA barkodlama çalışmalarında kullanılabilecek PCR başarısı bakımından değerlendirilmiştir. Ayrıca, kullanılan ekstraksiyon kitleri zahmet, fiyat ve zaman bakımından değerlendirilmiştir.
Sonuçlarımıza göre, yaprak ve gövde dokusundan genomik DNA ekstraksiyonu başarıyla gerçekleştirilmiştir. Tüm ekstraksiyon kitleri PCR amplifikasyonu bakımından başarılı olmasına rağmen en yüksek verim GeneMATRIX kiti kullanılarak elde edilmiştir.

Makale detayları

DNA from Leaf or Stem: A Comparative Work on Dianthus L. for DNA Barcoding Analysis with Four Commercial Extraction Kits

Yazarlar: Zübeyde UĞURLU AYDIN | Mustafa K. ŞENOVA | Marcus KOCH | Ali DÖNMEZ

Yayıncı: Hacettepe University

Ana Başlıklar: Uygulamalı fizik

Dergi: Hacettepe Journal of Biology and Chemistry 2020 Vol.48 Issue 4, pp.333-339

Belge Tipi: Makale

Yayın Tarihi: 7/2020

Belge Dili: İngilizce

Document ID (Org No.): 2000448221

Sıklık: Üç Aylık

eISSN: 2687-475X

pISSN: 2687-475X

DOI: https://doi.org/10.15671/hjbc.663505

Sayı

Yazarlar:

Zübeyde UĞURLU AYDIN | Mustafa K. ŞENOVA | Marcus KOCH | Ali DÖNMEZ

Yayıncı:

Hacettepe University

Ana Başlıklar:

Uygulamalı fizik

Dergi:

Hacettepe Journal of Biology and Chemistry 2020 Vol.48 Issue 4, pp.333-339

Belge Tipi:

Makale

Yayın Tarihi:

7/2020

Belge Dili:

İngilizce

Document ID (Org No.):

2000448221

Sıklık:

Üç Aylık

eISSN:

2687-475X

pISSN:

2687-475X

DOI:

https://doi.org/10.15671/hjbc.663505